Centimorgan

author
0 minutes, 58 seconds Read

Protože genetická rekombinace mezi dvěma markery je detekována pouze v případě, že mezi oběma markery existuje lichý počet chromozomálních křížení, vzdálenost v centimorganech neodpovídá přesně pravděpodobnosti genetické rekombinace. Za předpokladu mapové funkce J. B. S. Haldana, v níž je počet chromozomálních křížení rozdělen podle Poissonova rozdělení, povede genetická vzdálenost d centimorgánů k lichému počtu chromozomálních křížení, a tedy k detekovatelné genetické rekombinaci s pravděpodobností

Pr = ∑ k = 0 ∞ Pr {\displaystyle \Pr=\sum _{k=0}^{\infty }\Pr}.

= ∑ k = 0 ∞ e – d / 100 ( d / 100 ) 2 k + 1 ( 2 k + 1 ) ! = e – d / 100 sinh ( d / 100 ) = 1 – e – 2 d / 100 2 , {\displaystyle {}=\sum _{k=0}^{\infty }e^{-d/100}{\frac {(d/100)^{2\,k+1}}{(2\,k+1)!}}=e^{-d/100}\sinh(d/100)={\frac {1-e^{-2d/100}}{2}}\,,}

kde sinh je hyperbolická funkce sinus. Pravděpodobnost rekombinace je přibližně d/100 pro malé hodnoty d a blíží se 50 % s rostoucím d k nekonečnu.

Vzorec lze převrátit a získat tak vzdálenost v centimetrech jako funkci pravděpodobnosti rekombinace:

d = 50 ln ( 1 1 – 2 Pr ) . {\displaystyle d=50\ln \left({\frac {1}{1-2\Pr}}\right)\,.}

Similar Posts

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.