Naruto-fans er ikke fremmede for døden i manga-serien. Der er næsten for mange dødsfald og tragedier til at tælle i løbet af Naruto og Naruto: Shippuden. Mens læserne følger med Naruto og hans familie i Kishimoto og Kodachis serie Boruto: Naruto Next Generations, er fans bekymrede for, at Narutos død er uundgåelig. Men nogle fans ved måske ikke, at Naruto allerede blev dræbt i den oprindelige manga; heldigvis kom han tilbage til de levendes verden for at nå sit mål om at blive den største Hokage.
Naruto har været flere gange tæt på at dø. Han har kæmpet mod sin mangeårige rival, Sasuke Uchiha, flere gange, står over for den skurkagtige Orochimaru, beskytter sin landsby mod Pain og Kohan’s invasion og samler shinobi’erne mod Madara og Obito Uchiha. Naruto står endda over for de svansede bæster, chakramonstre med enorme kræfter, og kommer til sidst i kamp med selve skaberen af chakra, Kaguya Otsutsuki, i Naruto #678-699.
Hvor læserne kan få mening med Narutos død, må de først forstå hans forhold til sin bogstavelige indre dæmon, det nihalede bæst kaldet Kurama. Ræve-dæmonen, der blev lukket inde i ham som spædbarn, giver Naruto masser af spøjse, snedige og legesyge egenskaber; den giver ham også vanvittige mængder af ekstra kraftforøgelser, noget der gør Naruto til et mål. Stjæl rævedæmonen, arv dens kræfter. Naruto overlever flere forsøg fra fjender, der ønsker at stjæle Kurama fra ham, hvilket fører til hans død i mangaen, da den næste skurk ikke kun vil have den nihalede ræv, men alle ti af de svansede dyr for at gennemføre sin plan.
I buen af Den fjerde Shinobikrig, i Naruto #640-677, dræber Obito Uchiha effektivt Naruto, ved at adskille Naruto fra Kurama. Men er det virkelig Obito, der uddeler det skæbnesvangre slag? Obito planlægger sammen med Madara Uchiha den ultimative overtagelse af Naruto-universet og sætter gang i alle de begivenheder, der fører op til Shinobikrigens ark. Obito synes at være historiens skurk, indtil det afsløres, at Madara blot brugte Obito til sin egen vinding. Gennem en række komplicerede chakramanipulationer tvinges en døende og reformeret Obito til at bruge sine genoplivningskræfter til at genoplive den store skurk, Madara Uchiha, i en fysisk krop.
Gennem Obitos kræfter vender Madara tilbage til kampen og sætter sit mål på Naruto. Efter at være blevet dødeligt såret ved Kuramas adskillelse, er det Obitos omvendelse, der ironisk nok forhindrer Narutos glid ud i døden. I Naruto #662-663, der vises døende, indrømmer Sakura i Naruto #662-663, at Naruto ikke vil overleve uden sin chakraforbindelse til Kurama, da hendes medicinske ninjitsu ikke har nogen effekt på at helbrede ham. Naruto #666 viser Obito tage Kurama tilbage fra Madara og overføre det nihalede dyr tilbage til Naruto, hvilket redder Naruto fra dødens rand.
I slutningen af Naruto: Shippuden-mangaen, som ses i Naruto #698, deltager Naruto og hans mangeårige rival, Sasuke Uchiha, i en sidste kamp. De to dræber næsten hinanden begge to og afslutter kampen, da de bogstaveligt talt ikke kan kæmpe mod hinanden længere. De to accepterer deres gensidige nederlag, men mister begge en arm fra den voldsomme udveksling. Teknisk set tæller denne kamp med, da den kan ses som døden for Narutos rivalisering med Sasuke. Efter denne kamp ses de to som livslange venner og fortsætter deres venskab i den nyere Boruto-serie, hvor de skal håndtere den nye kamp med at opdrage familier og bekæmpe skurke. Boruto-fans kan være bekymrede for, at Naruto snart vil møde sin ende. Men måske vil Naruto og hans nihalede ven finde en anden måde at undslippe dødens horisont på, som de gjorde i mangaen.
