Hercules egy zsoldosbanda vezetője, melynek tagjai a lándzsás királyból lett argosi próféta Amphiaraus, a késdobáló spártai tolvaj Autolycus, a vad harcos thébai Tydeus, a szkíta amazon íjász Atalanta és unokaöccse, az athéni mesemondó Iolaus.
Herkules állítólag Zeusz félisten fia, aki a legendás Tizenkét Munkát azután végezte el, hogy Héra elárulta őt, aki őrületbe kergette, és Eurüsztheusz királynál tett látogatása során meggyilkoltatta feleségét, Megarát és gyermekeiket. A film során nem derül ki egyértelműen, hogy Herkules valóban Zeusz fia-e, és sokan szkeptikusak az állítással, valamint Herkules híres Tizenkét Munkájáról szóló történetekkel szemben. Ennek ellenére Herkules szokatlanul embertelen erőt és páratlan harci ügyességet mutat. Herkulest azonban gyakran kísérti a felesége és gyermekei halálának emléke, valamint a Cerberusról szóló látomások.
Miután befejezte egy nemrégiben végrehajtott küldetését és megmentette unokaöccsét az észak-görögországi Makedónia partvidékén Kr. e. 358-ban, Herkules és csapata egy tavernában ünnepel és iszik, amikor megkeresi őket Ergenia, Kotys király lánya, aki azt akarja, hogy Herkules képezze ki a trákiai seregeket, hogy megvédjék a királyságot a vérszomjas hadvezértől, Rhesus-tól. Herkules elfogadja, miután neki és embereinek felajánlják a súlyát aranyban, és a csapatot Cotys és Sitakles tábornok, a trák hadsereg vezetője üdvözli Trákiában.
Rhesus azonban elérte a Bessi törzset Közép-Trákiában, és Cotys ragaszkodik hozzá, hogy Herkules vezesse a sereget a csatába a Bessi védelmére, Herkules ellenvetései és a sereg kiképzetlenségének ellenére. Azonban elkéstek, mivel Rhesus feltételezett varázslata a besszitákat a trákok ellen fordította. Miután a Bessi-ket egy hosszú és katasztrofális csatát követően legyőzik, melynek következtében a trák haderő legalább fele elpusztul, Herkules és szövetségesei megfelelően kiképzik a sereget.
A kiképzés befejeztével Herkules és Sitaklész egynapos utazás után az Asticus hegy előtti csatatéren szembeszállnak Rhesusszal és katonáival. A trákok fáradságos csata után visszavonulásra kényszerítik Rhesus seregét, de Rhesus maga is kilovagol, hogy szembeszálljon Herkulessel, és legyőzi őt.
Rhesus fogolyként visszakerül Trákiába, ahol nyilvánosan kínozzák és megalázzák. Herkules megkönyörülve megakadályozza, hogy a városlakók további tárgyakat dobáljanak rá. Amikor Herkules megemlíti Rhesus tetteit, miszerint falvakat gyújtott fel, Rhesus azt mondja neki, hogy nem ő vagy a serege volt az, és azt mondja Herkulesnek, hogy a rossz oldalon harcolt.
Később a palota csarnokában Rhesus meg van láncolva és ki van állítva. Észrevéve, hogy Ergenia megkönyörült rajta, Herkules szembesíti őt, és megtudja, hogy Rhesus igazat mondott a falvakról, miszerint csupán megtorolta Cotys agresszív kísérleteit, hogy kiterjessze a királyságát. Bár Ergenia nem ért egyet Cotys módszereivel, félelemből belemegy, mivel apja megmérgezte a férjét, az előző királyt. Ráadásul Cotys fenyegeti a fiát, Ariust, a trón igazi örökösét.
A jutalmuk átvétele után a zsoldosok készen állnak az indulásra, de Hercules úgy dönt, hogy ott marad, hogy megállítsa Cotyst, és Autolycus kivételével mindenki úgy dönt, hogy követi őt. Azonban Sitaklész és emberei legyőzik és elfogják őket. Miközben Hercules meg van láncolva, szembekerül Eurystheus királlyal, aki Cotysszal szövetkezik. Eurüsztheusz elárulja, hogy elkábította Herkulest azon az éjszakán, amikor a családja meghalt, mert veszélyt látott benne a hatalmára nézve. Herkules családját valójában három, Eurüsztheusz által küldött fekete farkas ölte meg, aminek következtében Herkulesnek állandó hallucinációi vannak Cerberusról. Amikor Cotys elrendeli Ergenia kivégzését árulása miatt, Herkulest Amphiaraus bátorítja, hogy higgyen magában, ahogy mindenki hisz benne. Emberfeletti erejéről tanúbizonyságot téve Herkules kitör a láncaitól, megmenti Ergeniát és egyedül legyőzi a farkasokat. Herkules kiszabadítja a foglyokat, köztük Rhesus-t is, majd szembeszáll Eurystheusszal, felnyársalja a saját tőrével és megbosszulja a családját, azonban Szitaklész rajtaüt, akit aztán a titokban ügyességét csiszoló Iolausz halálra szúr.
Kint Herkules és csapatai Cotys és serege ellen harcolnak. Ariust túszul ejtik, de Autolycus megmenti, aki úgy döntött, hogy visszatér, hogy segítsen barátainak. Az ezt követő csatában Tydeus halálosan megsebesül, miközben Ariust védi, de tovább harcol, számos trák katonát lemészárolva, amíg el nem esik; később Herkules karjaiban hal meg. Héraklész ismét embertelen erőt használva letaszít egy hatalmas Héra-szobrot az alapjairól, és azzal szétzúzza Kotüszt és számos katonáját. A megmaradt katonák látják Herkulest, miközben a háttérben villámok cikáznak. A túlélő katonák meghajolnak Herkules előtt, és Arius elfoglalja a trónt, Ergeniával az oldalán. A stáblista lejátszása közben a Tizenkét munka animált elbeszélése mutatja be, hogyan vitte véghez Herkules ezeket a hőstetteket társai segítségével.