A Naruto rajongók számára nem idegen a halál a mangasorozatban. A Naruto és a Naruto: Shippuden során szinte megszámlálhatatlanul sok haláleset és tragédia történt. Miközben az olvasók Kishimoto és Kodachi Boruto: Naruto Next Generations sorozatában Narutóval és családjával tartják a lépést, a rajongók attól tartanak, hogy Naruto halála elkerülhetetlen. De néhány rajongó talán nem tudja, hogy Naruto már az eredeti mangában is meghalt; szerencsére visszatért az élők világába, hogy elérje célját, és a legnagyobb Hokage legyen.
Naruto már többször is közel került a halálhoz. Többször megküzdött hosszú távú riválisával, Sasuke Uchihával, szembeszállt a gonosztevő Orochimaruval, megvédi faluját Pain és Kohan inváziójától, és összefogja a shinobikat Madara és Obito Uchiha ellen. Naruto még a farkú szörnyek, hatalmas erejű csakraszörnyek ellen is szembeszáll, végül magával a csakra teremtőjével, Kaguya Otsutsukival csap össze a Naruto #678-699-ben.
Mielőtt az olvasók megértenék Naruto halálát, először meg kell érteniük a kapcsolatát a szó szoros értelmében vett belső démonával, a Kurama nevű Kilencfarkú Szörnyeteggel. A csecsemőként beléje zárt rókadémon rengeteg szeleburdi, trükkös és játékos tulajdonságot ad Narutónak; emellett őrült mennyiségű további erőnövelést is ad neki, ami Narutót célponttá teszi. Lopd el a rókadémont, örököld az erejét. Naruto több kísérletet is túlél az ellenségektől, akik el akarják lopni tőle Kuramát, ami a manga halálához vezet, mivel ez a következő gonosztevő nem csak a Kilencfarkú Rókát akarja, hanem mind a tíz farkú fenevadat, hogy véghezvigye a tervét.
A negyedik Shinobi háború ívében, a Naruto #640-677-ben Obito Uchiha ténylegesen megöli Narutót, azzal, hogy elválasztja Narutót Kuramától. De vajon tényleg Obito az, aki a végzetes csapást mérte rá? Obito Madara Uchihával együtt a Naruto-univerzum végső hatalomátvételét tervezi, és ezzel elindítja az összes eseményt, amely a Shinobi-háború ívéhez vezet. Obito tűnik a történet gonosztevőjének, amíg ki nem derül, hogy Madara csak kihasználta Obitót a saját céljaira. Egy sor bonyolult chakra-manipuláció révén a haldokló és megreformált Obito arra kényszerül, hogy a feltámadás erejét használja, hogy a nagy gonoszt, Madara Uchihát fizikai testbe visszahozza.
Obito ereje révén Madara visszatér a csatába, és Narutót veszi célba. Miután halálos sérülést szenved Kurama leválasztása után, Obito szívének megváltozása az, ami ironikus módon megakadályozza Naruto halálba csúszását. A Naruto #662-663-ban Sakura haldoklónak mutatva beismeri, hogy Naruto nem fogja túlélni a Kuramával való chakrakapcsolata nélkül, mivel orvosi ninjitsuja nincs hatással a gyógyítására. A Naruto #666 mutatja, ahogy Obito visszaveszi Kuramát Madarától, és visszahelyezi a Kilencfarkú szörnyeteget Narutóba, megmentve Narutót a halál széléről.
A Naruto: Shippuden manga végén, a Naruto #698-ban látható Naruto és régi riválisa, Sasuke Uchiha végső csatát vívnak. Mindketten majdnem megölik egymást, és akkor vetnek véget a harcnak, amikor már szó szerint nem tudnak tovább küzdeni egymással. Mindketten elfogadják a kölcsönös vereséget, de mindketten elveszítik egy-egy karjukat az erőszakos szóváltás következtében. Gyakorlatilag ez is számít, mivel ez tekinthető Naruto és Sasuke rivalizálásának halálának. Ezt a harcot követően kettejüket életre szóló barátoknak tekintik, barátságuk az újabb Boruto-sorozatban is folytatódik, miközben a családalapítás és a rosszfiúk elleni harc új küzdelmével küzdenek. A Boruto rajongók aggódhatnak, hogy Naruto hamarosan véget ér. De talán Naruto és Kilencfarkú barátja találnak majd egy másik utat, hogy megmeneküljenek a halál látóhatárától, ahogy a mangában is tették.