Martinez foi acusado de drogas federais em julho de 1990 com dois outros homens, mas a acusação contra Martinez foi arquivada quando ele permaneceu como fugitivo no início do julgamento, em novembro de 1991. Segundo a declaração juramentada, Nathaniel Watkins (primo de Rich Porter), co-réu de Martinez no caso Alexandria, disse ao FBI em 1989 que estava presente quando Martinez deu $300.000 a um colega traficante de drogas em um quarto de hotel da Crystal City e instruiu o homem a levar o dinheiro para Nova York. Watkins disse ao FBI que o traficante viajou para Nova York em uma limusine, que ele e sua namorada seguiram, e foram para um apartamento no Harlem onde conheceram Martinez, que tinha voado para Nova York. Em 7 de novembro de 1991, Martinez foi preso em Washington D.C. por vender drogas. Foi acusado de conspiração para cometer homicídio, várias acusações de drogas e 14 acusações de homicídio, incluindo o homicídio do traficante de drogas Michael Anthony Salters aka Fray e Demencio Benson, de Brooklyn. Enfrentando a possibilidade de pena de morte ou prisão perpétua sem possibilidade de liberdade condicional, Martinez virou informante e testemunhou contra membros de sua organização. Por seu testemunho contra Perry (que recebeu cinco condenações perpétuas consecutivas sem possibilidade de liberdade condicional), Martinez foi condenado a 35 anos de prisão.
De acordo com o site da Revista Don Diva, Alberto “Alpo” Martinez, 49 anos, foi libertado de uma prisão federal do WITSEC FCI em 2015. De acordo com o site, Martinez estava no programa federal de proteção a testemunhas aguardando uma nova identidade.