Chemical Crosslinking: Háttér: A fehérje- és peptidtudományban betöltött szerepe

author
2 minutes, 59 seconds Read

Háttér: A kémiai keresztkötés két vagy több molekula intermolekuláris vagy intramolekuláris összekapcsolását jelenti kovalens kötéssel. Az e célra használt reagenseket “térhálósító reagenseknek” vagy “térhálósítóknak” nevezik. Olyan tényezők alapján, mint a reakcióképesség és a távtartó hossza, ezeket különböző típusokba sorolják, amelyek mindegyike sajátos funkcióval és alkalmazással rendelkezik. Az utóbbi időben a kémiai térhálósítás hatékony eszközzé vált a biomolekulák, például a fehérjék vizsgálatában. Különböző vizsgálatokban alkalmazható, beleértve a fehérjék szilárd hordozóhoz való rögzítését a membránreceptorok, fehérje-fehérje komplexek, fehérje-DNS komplexek és mások tanulmányozásához. Olyan technikákkal párosítva, mint a tömegspektroszkópia, nemcsak a fehérjék háromdimenziós szerkezetének meghatározására, hanem a fehérje-fehérje kölcsönhatások tanulmányozására és az érdekes helyek meghatározására is használják. A tömegspektrometriás technikák és a bioinformatika kombinációja egy újabb dimenzióval bővítette a fehérjekémia mai megértését. A kémiai térhálósításnak tehát számos felhasználási módja van.

Módszerek: A kutatási irodalom áttekintéséhez szisztematikus keresést végeztünk a bibliográfiai adatbázisokban és keresőmotorokban, mint például a Google Scholar, Scifinder, Scopus, Mendeley stb. Kizártuk azokat a kutatási cikkeket, amelyek csak a térhálósító molekulák szintéziséről számoltak be, és nem tartalmaztak tömegspektrometriás vizsgálatokat.

Eredmények: Hatvannégy cikket vontunk be az áttekintésbe. A hivatkozások többsége az elmúlt tíz évből származott, mivel az utóbbi években óriási fejlődés történt ezen a területen. Tizenegy klasszikus tanulmányt vettek fel ezen a területen, amelyek ennek a módszertannak az alapjairól szólnak. Harminckét cikk a kémiai térhálósító anyagok tervezéséhez használt különböző típusú szerves csoportokat és a térhálósítás hatékonyságának növelésére használt különböző módszereket tárgyalta. Ezek a tanulmányok rávilágítanak a keresztkötésű fehérjék kimutatásának fokozására használt különböző stratégiákra és a tömegadatokból a keresztkötési helyek kimutatására használt különböző számítógépes szoftverekre is. Huszonegy cikk mutatta be e módszertan koncepcionális alkalmazását a fehérjék keresztkötésének in vivo és in vitro kimutatására.

Következtetés: Az áttekintés eredményei megerősítik a tömegspektroszkópiával kombinált kémiai keresztkötés fontosságát, mint a fehérje-fehérje kölcsönhatás megértésének olcsó alternatíváját. Az ezzel a módszertannal előállított információk segíthetnek a különböző betegségek jobb megértésében és az ellenük való jobb gyógyszerek kifejlesztésében.

Similar Posts

Vélemény, hozzászólás?

Az e-mail-címet nem tesszük közzé.