A hatéves JonBenét Ramsey-t megölték a coloradói Boulderben lévő otthonában. John és Patsy Ramsey, a lány szülei másnap reggel 5:52-kor hívták a rendőrséget, hogy bejelentse lányuk eltűnését. Bár a rendőrség talált egy váltságdíj követelő levelet, amelyben 118 000 dollárt követeltek, a pénzre nem volt szükség, mert JonBenét holttestét még aznap délután megtalálták a pincében egy takaró alatt. A bűncselekmény hamarosan országos szenzációvá vált.
Nézze meg a Ki ölte meg JonBenétet? című filmet a Lifetime Movie Clubon
A megvert és megfojtott JonBenétet ragasztószalaggal a száján és egy zsinórral összekötözött kezekkel találták meg. Szexuális bántalmazásra utaló jelek is voltak. A boulderi nyomozók azonban rossz munkát végeztek a bizonyítékok megőrzésében, és valójában megengedték John Ramsey-nek, hogy megzavarja a helyszínt azzal, hogy kivitte lánya holttestét az alagsorból.
Mivel nem volt jele betörőnek, a gyanú hamar JonBenét szüleire terelődött.A váltságdíjat követelő levél gyanúsnak tűnt a hatóságoknak. Nemcsak a váltságdíj furcsán konkrét összege – 118 000 dollár – egyezett pontosan John Ramsey munkáltatójától kapott prémium összegével, hanem az a papír is, amelyre a váltságdíjkérő levél íródott, amelyet a Ramsey-házban találtak. Az üzenet emellett szokatlanul szókimondónak tűnt.
A kíváncsi közönség számára az a tény, hogy John és Patsy Ramsey nem működött együtt a nyomozással, tovább táplálta a bűnösségükkel kapcsolatos találgatásokat. Ráadásul JonBenét aktív részvételét a szépségversenyeken, amelyekhez erős sminket és kifinomult ruházatot kellett viselnie, széles körben helytelennek tartották.
A nyomozás JonBenét meggyilkolásának ügyében több mint két évig tartott. De 1999 októberében az ügyben bizonyítékokat meghallgató esküdtszék végül vádemelési javaslat nélkül feloszlatta az ügyet. 2006-ban letartóztatták John Mark Karr egykori tanárt, miután beismerte a gyilkosságot; Karr DNS-e azonban nem egyezett a JonBenét testén talált mintákkal, ezért szabadon engedték.