Centimorgans

author
0 minutes, 52 seconds Read

Omdat genetische recombinatie tussen twee merkers alleen wordt gedetecteerd als er een oneven aantal chromosomale crossovers tussen de twee merkers is, komt de afstand in centimorgans niet precies overeen met de waarschijnlijkheid van genetische recombinatie. Uitgaande van de kaartfunctie van J.B.S. Haldane, waarin het aantal chromosomale crossovers volgens een Poisson-verdeling is verdeeld, zal een genetische afstand van d centimorgans leiden tot een oneven aantal chromosomale crossovers, en dus tot een detecteerbare genetische recombinatie, met kans

Pr = ∑ k = 0 ∞ Pr {displaystyle \Pr=\sum _{k=0}^{\infty }\Pr}

= ∑ k = 0 ∞ e – d / 100 ( d / 100 ) 2 k + 1 ( 2 k + 1 ) ! = e – d / 100 sinh ( d / 100 ) = 1 – e – 2 d / 100 2 , {\displaystyle {}=\sum _{k=0}^{\infty }e^{-d/100}{\frac {(d/100)^{2,k+1}}{(2,k+1)!}}=e^{-d/100}{sinh(d/100)={\frac {1-e^{-2d/100}}{2}},,}

waar sinh de hyperbolische sinusfunctie is. De kans op recombinatie is ongeveer d/100 voor kleine waarden van d en nadert 50% als d naar oneindig gaat.

De formule kan worden omgekeerd, waardoor de afstand in centimorganen als functie van de recombinatiekans wordt verkregen:

d = 50 ln ( 1 1 – 2 Pr ) . {\displaystyle d=50,00ln \left({\frac {1}{1-2\Pr}}right)}

Similar Posts

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.