Harry Potter en de Steen der Wijzen
Hermelien verschijnt voor het eerst in Harry Potter en de Steen der Wijzen wanneer ze Harry en Ron ontmoet op de Zweinsteinexpres, waar ze Ron uitlacht omdat hij niet in staat is een spreuk uit te voeren om zijn rat geel te kleuren. Ze bewijst hoeveel ze weet door te verklaren dat ze alle schoolboeken uit haar hoofd heeft geleerd. Ze ergert haar medeleerlingen voortdurend met haar kennis, zodat Harry en Ron haar aanvankelijk arrogant vinden, vooral nadat ze Rons bezwering van de levitatie toverspreuk bekritiseert. Ze hebben een hartgrondige hekel aan haar totdat ze haar redden van een trol, waarvoor ze zo dankbaar is dat ze liegt om hen voor straf te behoeden, en zo hun vriendschap wint. Hermelien’s talent voor logica stelt het trio later in staat een puzzel op te lossen die essentieel is voor het terugvinden van de Steen der Wijzen, en ze verslaat de verstikkende Duivelsstrik plant door een straal van “bluebell flame” op te roepen.
Hermelien is het brein achter het plan om de plaats waar de Steen verborgen is binnen te gaan. Zij reageert op Harry’s argwaan jegens Professor Severus Snape en is ook wantrouwig jegens hem. Ze onthult aan Harry en Ron dat ze veel onderzoek doet in de bibliotheek, wat haar hielp de Duivelsstrik te verslaan en de logica van de toverdranken uit te werken.
Rowling zei op haar website dat ze de verzoeken van haar redacteur om de trollen-scène te verwijderen heeft weerstaan, en verklaarde: “Hermelien is zo ontzettend arrogant en vervelend in het begin van Philosopher’s Stone dat ik echt het gevoel had dat er iets (letterlijk) groots nodig was om haar samen te brengen met Harry en Ron.”
Harry Potter en de Geheime Kamer
Hermelien (samen met Rons moeder Molly Wemel en een paar vrouwelijke leerlingen van Zweinstein) ontwikkelt een voorliefde voor leraar Verweer tegen de Zwarte Kunsten Gilderoy Lockhart, omdat hij alle boeken had geschreven die nodig waren voor het vak Verweer tegen de Zwarte Kunsten in Harry Potter en de Geheime Kamer. Tijdens een ochtendconfrontatie tussen de Gryffindor en Slytherin Zwerkbalploegen ontstaat er bijna een vechtpartij nadat Draco Malfoy haar een “Modderbloedje” noemt, een scheldwoord voor tovenaars die in Dreuzels geboren zijn, wanneer ze het Gryffindor Zwerkbalteam verdedigt. Ze brouwt het Veelvoudsap Drankje dat nodig is voor het trio om zich te vermommen als Draco’s huisgenoten om informatie te verzamelen over de Erfgenaam van Slytherin die de Geheime Kamer heropend heeft. Ze kan zich echter niet bij Harry en Ron voegen in het onderzoek nadat het haar van de gewaden van Slytherin studente Millicent Bulstrode (met wie Hermelien eerder was gekoppeld tijdens Lockhart’s onfortuinlijke Duelling Club) dat van haar kat was, wiens uiterlijk ze aanneemt in haar menselijke vorm; het duurt enkele weken voordat de effecten volledig zijn uitgewerkt. Hermelien wordt versteend door de basilisk nadat ze het schepsel met succes heeft geïdentificeerd via bibliotheekonderzoek. Hoewel ze in de hospitaal vleugel ligt, is de informatie die ze heeft gevonden en achtergelaten van cruciaal belang voor Harry en Ron in hun succesvolle missie om het mysterie van de Geheime Kamer op te lossen. Hermelien komt weer tot leven nadat Harry de basilisk heeft gedood, maar ze is radeloos als ze hoort dat alle eindejaarsexamens zijn afgelast als schooltraktatie.
Harry Potter en de Gevangene van Azkaban
Hermelien koopt een kat genaamd Crookshanks, die het opneemt tegen Ron’s rat, Scabbers. Voor het begin van het schooljaar geeft Professor McGonagall Hermelien in het geheim een Tijdmachine, een apparaat waarmee ze terug kan gaan in de tijd en haar zware lessenrooster kan afwerken, hoewel dit pas in het voorlaatste hoofdstuk wordt onthuld. Er ontstaat veel spanning tussen Hermelien en haar twee beste vrienden; Harry is woedend op haar omdat ze McGonagall heeft verteld dat hij een Vuurbol heeft gekregen, die in beslag is genomen om te worden geïnspecteerd op sporen van duistere magie. Ron is boos omdat hij denkt dat Crookshanks verantwoordelijk is voor de verdwijning van Scabbers, terwijl Hermelien vurig volhoudt dat Crookshanks onschuldig is.
Terwijl hij invalt voor Remus Lupin in een les Verweer tegen de Zwarte Kunsten, bestempelt Snape Hermelien als “een onuitstaanbare betweter” en straft hij Gryffindor nadat ze voor haar beurt spreekt in haar poging een weerwolf te beschrijven terwijl niemand anders dat doet. Ze leidt het geheim van Lupin correct af nadat ze Snape’s huiswerkopdracht van de klas heeft afgemaakt. Crookshanks is van vitaal belang bij het ontmaskeren van Scabbers als Peter Pettigrew, een vroegere vriend van James en Lily Potter, die hun verblijfplaats aan Lord Voldemort onthulde op de avond van hun moorden, en in staat was om Sirius Black (die Harry’s peetvader bleek te zijn) ten onrechte te beschuldigen van de dood van de Potters. De Tijdmachine stelt Hermelien en Harry in staat om Sirius en het nijlpaard Bokbek te redden.
Harry Potter en de Vuurbeker
Hermelien is geschokt door de wreedheid die huiselven ondergaan, en richt S.P.E.W. op, de Vereniging ter Bevordering van het Elfenwelzijn, als een poging om basisrechten voor hen te krijgen. Zij is de date van het Bulgaarse Zwerkbalwonder Viktor Krum op het Yule Ball van het Toverschool Toernooi. De juiste uitspraak van haar naam (Her-my-oh-nee) wordt in het verhaal betrokken wanneer ze die aan Krum leert; het beste wat hij kan doen is “Herm-own-ninny,” maar zij heeft er geen problemen mee. Later krijgt ze een verhitte discussie met Ron nadat hij haar beschuldigt van “verbroedering met de vijand” over haar vriendschap met Krum. In het boek wordt er gezinspeeld op Hermeliens gevoelens voor Ron wanneer ze zegt dat Ron haar niet kan zien “als een meisje”, maar Krum wel. Ze steunt Harry tijdens het Toverschool Toernooi en helpt hem bij de voorbereiding van elke taak. Op het einde van de tweede taak vraagt Krum haar om hem tijdens de zomer in Bulgarije te komen opzoeken, maar ze weigert beleefd. Tegen het einde van het trimester stopt ze de frauduleuze tabloid reporter en ongeregistreerde Animagus, Rita Skeeter, die lasterlijk materiaal over Hermelien, Harry, en Hagrid had gepubliceerd tijdens het Toverschool Toernooi, door haar Animagus vorm (een kever) gevangen te houden in een pot.
Harry Potter en de Orde van de Feniks
Hermelien wordt samen met Ron prefect van Gryffindor en raakt bevriend met Loena Lovegood, maar hun vriendschap krijgt een wankele start nadat Hermelien de publicatie van Loena’s vader afkraakt: “De Quibbler is onzin, iedereen weet dat.” Ze verwijt huisgenote Lavender Brown ook dat ze de beweringen in de Dagelijkse Profeet gelooft dat Harry verhalen verzint over de terugkeer van Voldemort. Ron en Hermelien kibbelen veel van hun tijd, waarschijnlijk vanwege hun groeiende romantische gevoelens voor elkaar, maar ze blijven Harry trouw. Een keerpunt in de serie is wanneer Hermelien het idee opvat om Harry in het geheim les te laten geven in weerbaarheidstoverij aan een klein groepje leerlingen, in weerwil van het voorschrift van het Ministerie van Toverkunst om alleen de basisprincipes van het vak uit een leerboek te leren, zonder praktijkoefeningen. Hermelien krijgt een onverwacht grote respons, en de groep wordt het ontluikende Perkamentus’ Leger. Ze raakt betrokken bij de strijd in het Departement van Mysteries en raakt ernstig gewond door een spreuk van Dooddoener Antonin Dolohov, maar herstelt volledig.
Harry Potter en de Halfbloed Prins
De nieuwe professor Toverdranken Horace Slughorn nodigt Hermelien uit om lid te worden van zijn “Slakkenclub”, en ze helpt Ron zijn plaats in het Zwerkbalteam van Gryffindor te behouden wanneer ze een vloekspreuk over Cormac McLaggen uitspreekt, waardoor hij zijn laatste reddingspoging mist tijdens de Keepersproeven. Hermelien’s gevoelens voor Ron blijven groeien en ze besluit een poging te wagen door hem uit te nodigen voor Slughorn’s Kerstfeest, maar hij versiert Lavendel als vergelding voor zijn overtuiging dat Hermelien jaren eerder met Krum had gezoend. Ze probeert wraak te nemen door met McLaggen uit te gaan op het Kerstfeest, maar haar plan loopt mis en ze verlaat hem halverwege het feest. Ron en Hermelien blijven ruzie met elkaar maken (Ron is boos op haar omdat ze vogels heeft opgezet om hem aan te vallen nadat ze hem en Lavendel heeft zien zoenen; Hermelien is vooral boos vanwege haar groeiende jaloezie) totdat hij een bijna fatale vergiftiging oploopt door bedorven honingdrank, wat haar genoeg angst inboezemt om zich met hem te verzoenen. Na Dumbledore’s dood zweren Ron en Hermione beiden aan Harry’s zijde te blijven, wat er ook gebeurt. Een klein subplot in het boek is dat Hermelien en Harry een rivaliteit vormen in Toverdranken, omdat Hermelien gewend is als eerste te eindigen in haar vakken en boos is dat Harry haar onverdiend overtreft door tips en andere instructies op te volgen die door de vorige eigenaar in de kantlijn van Harry’s toverdrankenboek zijn geschreven. Hermelien is ook de enige van het trio die slaagt voor haar Verschijningstest (Ron slaagde nipt niet, en Harry was te jong).
Harry Potter and the Deathly Hallows
In het zevende en laatste boek vergezelt Hermelien Harry op zijn zoektocht om de overgebleven Horcruxes van Voldemort te vernietigen. Voordat ze op deze zoektocht vertrekt, helpt ze haar ouders veilig te stellen door hen te betoveren met een vals geheugen, zodat ze denken dat ze Wendell en Monica Wilkins zijn, die de ambitie hebben om naar Australië te verhuizen. Ze erft Perkamentus’ exemplaar van De Vertellingen van Beedle de Bard, waarmee ze enkele geheimen van de Doodsbloemen kan ontcijferen. Ze bereidt zich voor op hun vertrek en reis door een Ondetecteerbare Verlengspreuk op een klein kralen tasje te plaatsen, zodat ze de oneindige diepte van de tas kan vullen met materialen die ze nodig zullen hebben. Hermelien’s spreuk redt haar en Harry van Heer Voldemort en zijn slang Nagini in Godric’s Hollow, hoewel de ricochet Harry’s toverstok doet breken. Als zij, Ron en Harry gevangen worden genomen door Snatchers, die op bevel van het Ministerie op Dreuzelbloedjes jagen, vermomt Hermelien Harry door zijn gezicht tijdelijk te verminken met een Stekende Vloek. Ze probeert zich ook voor te doen als voormalig Zweinstein studente Penelope Clearwater en een halfbloed om vervolging te voorkomen, maar ze worden herkend en naar Malfoy Manor gebracht. Bellatrix Lestrange martelt haar met de Cruciatusvloek in een poging informatie los te krijgen over hoe Hermelien, Harry en Ron aan het zwaard van Godric Gryffindor zijn gekomen (dat veilig in de kluis van Lestrange in Gringotts had moeten liggen). Bellatrix geeft Griphook de kobold de opdracht het zwaard te inspecteren en te vertellen of het nep of echt is. Om Hermelien te redden, overtuigt Harry hem om tegen Bellatrix te liegen dat het zwaard nep is. Als de anderen uit hun cel ontsnappen, dreigt Bellatrix Hermelien de keel door te snijden. Hermelien, Harry, Ron en de andere gevangenen die in Malfoy Manor worden vastgehouden, worden uiteindelijk gered door Dobby.
Hermelien gebruikt later Veelvoudsap om zich voor te doen als Bellatrix wanneer het trio probeert de beker van Hufflepuff te stelen uit Gringotts. Zij, Harry en Ron sluiten zich aan bij het leger van Perkamentus in de Slag om Zweinstein, waarbij Hermelien de beker van Hufflepuff in de Geheime Kamer vernietigt met de slagtand van een basilisk, waardoor nog een Horcrux verdwijnt. Hermelien en Ron delen ook hun eerste kus tijdens het gevecht. In het laatste gevecht in de Grote Zaal, vecht Hermelien tegen Bellatrix met de hulp van Ginny Wemel en Luna. Ze zijn echter met z’n drieën niet in staat Bellatrix te verslaan en stoppen met vechten zodra Molly Wemel hen beveelt zich terug te trekken.