Chociaż testy Pap umożliwiły wczesne wykrycie zmian przednowotworowych, wprowadzenie nowych urządzeń zbierających znacznie poprawiło wykrywanie zmian ukrytych w kanale endocervical, takich jak adenocarcinoma in situ (AIS). Termin „atypowe komórki gruczołowe o nieustalonym znaczeniu” (atypical glandular cells of undetermined significance – AGUS) został wprowadzony na konferencji w Bethesda w 1988 roku i zdefiniowany jako zmiany morfologiczne w komórkach gruczołowych wykraczające poza te, które sugerują łagodny proces reaktywny, ale niewystarczające do rozpoznania gruczolakoraka in situ (adenocarcinoma in situ – AIS). W nowym Systemie Bethesda z 2001 r. termin ten został wyeliminowany i zastąpiony terminem „atypowe komórki gruczołowe” (AGC), z następującymi podklasyfikacjami: not otherwise specified (NOS), favor neoplasia, endocervical AIS i adenocarcinoma. Ryzyko wystąpienia choroby przednowotworowej lub złośliwej związane z kategorią AGC favor neoplasia jest znacznie wyższe niż w kategorii AGC NOS (odpowiednio 96% vs. 9-41%). Pacjentki z rozpoznaniem AGC NOS lub AGC favor neoplasia będą wymagały kolposkopii, pobrania próbek endocervicalnych, a w przypadku pacjentek powyżej 35 roku życia biopsji endometrium. Jeśli wszystkie te testy są ujemne, test Pap należy powtarzać w odstępach 4-6 miesięcy, aż do uzyskania 4 kolejnych prawidłowych testów. Dodatni wynik jednego z testów będzie wymagał postępowania zgodnie z wytycznymi ASCCP. Rozpoznanie AGC favor neoplasia wymaga również wykonania konizacji szyjki macicy i/lub innych badań, ponieważ częstość występowania zmian przednowotworowych lub złośliwych u pacjentek z tym rozpoznaniem jest wysoka. Rola testów HPV w tym przypadku nie jest obecnie znana.