Centimorgans

author
0 minutes, 56 seconds Read

Om genetisk rekombination mellan två markörer upptäcks endast om det finns ett udda antal kromosomala korsningar mellan de två markörerna, motsvarar avståndet i centimorgans inte exakt sannolikheten för genetisk rekombination. Om man utgår från J. B. S. Haldanes kartfunktion, där antalet kromosomala korsningar fördelas enligt en Poissonfördelning, kommer ett genetiskt avstånd på d centimorganer att leda till ett udda antal kromosomala korsningar, och därmed en påvisbar genetisk rekombination, med sannolikhet

Pr = ∑ k = 0 ∞ Pr {\displaystyle \Pr=\sum _{k=0}^{\infty }\Pr}

= ∑ k = 0 ∞ e – d / 100 ( d / 100 ) 2 k + 1 ( 2 k + 1 ) ! = e – d / 100 sinh ( d / 100 ) = 1 – e – 2 d / 100 2 , {\displaystyle {}=\sum _{k=0}^{\infty }e^{-d/100}{\frac {(d/100)^{2\,k+1}}{(2\,k+1)!}}}=e^{-d/100}\sinh(d/100)={\frac {1-e^{-2d/100}}{2}}}\,,}

där sinh är den hyperboliska sinusfunktionen. Sannolikheten för rekombination är ungefär d/100 för små värden på d och närmar sig 50 % när d går mot oändligheten.

Formeln kan inverteras, vilket ger avståndet i centimeter som en funktion av rekombinationssannolikheten:

d = 50 ln ( 1 1 1 – 2 Pr ) . {\displaystyle d=50\ln \left({\frac {1}{1-2\Pr}}\right)\,.}

Similar Posts

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.