Můžete používat SMART ve dvou různých režimech: normálním nebo genomickém.Hlavní rozdíl je v použité základní databázi proteinů. V normálním režimu SMART obsahuje databáze Swiss-Prot, SP-TrEMBL a stabilní proteomy Ensembl. V genomickém SMART se používají pouze proteomy kompletně sekvenovaných genomů; Ensembl pro metazoany a Swiss-Prot pro ostatní. Kompletní seznam genomů v Genomic SMART je k dispozici zde.
Báze proteinů v Normal SMART má značnou redundanci, i když jsou odstraněny identické proteiny. Pokud používáte SMART ke zkoumání architektury domén nebo chcete zjistit přesný počet domén v různých genomech, zvažte přepnutí do režimu Genomic. Počty na stránkách s anotacemi domén budou přesnější a ve výsledcích dotazů na architekturu nebude mnoho proteinových fragmentů odpovídajících stejnému genu. Nezapomeňte však, že zkoumáte omezenou sadu genomů.
Různá barevná schémata slouží ke snadné identifikaci režimu, ve kterém se nacházíte.
| Normální režim | Genomický režim |
 |
 |
Kliknutím na výše uvedené obrázky vyberete svůj výchozí režim.
Informace o vybraném režimu se ukládají do souboru cookie prohlížeče. Pokud z jakéhokoli důvodu nechcete/nemůžete používat soubory cookie, přistupujte ke službě SMART prostřednictvím této stránky.