Du kan bruge SMART i to forskellige tilstande: normal eller genomisk.Hovedforskellen ligger i den underliggende proteindatabase, der anvendes. I normal SMART indeholder databasen Swiss-Prot, SP-TrEMBL og stabile Ensembl-proteomer. I Genomic SMART anvendes kun proteomer fra fuldstændigt sekventerede genomer; Ensembl for metazoer og Swiss-Prot for resten. Den komplette liste over genomer i Genomic SMART er tilgængelig her.
Proteindatabasen i Normal SMART har betydelig redundans, selv om identiske proteiner er fjernet. Hvis du bruger SMART til at udforske domænearkitekturer eller ønsker at finde nøjagtige domæneantal i forskellige genomer, skal du overveje at skifte til Genomic-tilstand. Tallene på siderne med domæneannotationer vil være mere nøjagtige, og der vil ikke være mange proteinfragmenter, der svarer til det samme gen, i resultaterne af arkitektursøgningen. Husk dog, at du udforsker et begrænset sæt genomer.
Der anvendes forskellige farveskemaer for nemt at identificere den tilstand, du er i.
Normal tilstand | Genomisk tilstand |
Klik på billederne ovenfor for at vælge din standardtilstand.
Informationer om din valgte tilstand gemmes i en browsercookie. Hvis du af en eller anden grund ikke ønsker/kan bruge cookies, kan du få adgang til SMART via denne side.