Vælg din standard SMART-tilstand

author
0 minutes, 59 seconds Read

Du kan bruge SMART i to forskellige tilstande: normal eller genomisk.Hovedforskellen ligger i den underliggende proteindatabase, der anvendes. I normal SMART indeholder databasen Swiss-Prot, SP-TrEMBL og stabile Ensembl-proteomer. I Genomic SMART anvendes kun proteomer fra fuldstændigt sekventerede genomer; Ensembl for metazoer og Swiss-Prot for resten. Den komplette liste over genomer i Genomic SMART er tilgængelig her.

Proteindatabasen i Normal SMART har betydelig redundans, selv om identiske proteiner er fjernet. Hvis du bruger SMART til at udforske domænearkitekturer eller ønsker at finde nøjagtige domæneantal i forskellige genomer, skal du overveje at skifte til Genomic-tilstand. Tallene på siderne med domæneannotationer vil være mere nøjagtige, og der vil ikke være mange proteinfragmenter, der svarer til det samme gen, i resultaterne af arkitektursøgningen. Husk dog, at du udforsker et begrænset sæt genomer.

Der anvendes forskellige farveskemaer for nemt at identificere den tilstand, du er i.

Normal tilstand Genomisk tilstand

Klik på billederne ovenfor for at vælge din standardtilstand.

Informationer om din valgte tilstand gemmes i en browsercookie. Hvis du af en eller anden grund ikke ønsker/kan bruge cookies, kan du få adgang til SMART via denne side.

Similar Posts

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.