Suojeluasemastaan huolimatta avoimen preerian häviäminen on pienentänyt preerikoirapopulaatiota dramaattisesti. 1900-luvun alussa preerikoirat asuttivat 100 miljoonaa hehtaaria (40 miljoonaa hehtaaria) Suuria tasankoja Kalliovuorten itäpuolella Kanadasta Meksikoon. Nykyään tämä alue on pienentynyt alle 2 miljoonaan hehtaariin (766 400 hehtaariin). Maatalous ja kaupungistuminen ovat vastuussa preerikoirien elinympäristön jyrkästä häviämisestä ja pirstoutumisesta.
Preerikoiria on pidetty tuholaisina, ja ne on hävitetty (myrkyttämällä ja ampumalla), koska niiden on katsottu kilpailevan laiduntavien nautojen ja biisonien kanssa ruohosta. Tutkimukset osoittavat kuitenkin, että preeriakoirat eivät vaikuta merkittävästi karjan käytettävissä olevan kasvillisuuden määrään.
Mustahäntäiset preeriakoirat kamppailevat myös tahattomasti maahan levinnyttä tautia, sylväsruttoa, vastaan. Tämän tartunnan aiheuttaa kirppujen levittämä bakteeri, ja se voi olla hyvin vakava, sillä se voi tappaa yli 99 prosenttia yhdyskunnasta. Ruton vakavuudesta huolimatta U.S. Fish and Wildlife Service on todennut, että preeriakoirat eivät ole merkittävästi uhanalaisia, koska ne pystyvät toipumaan populaatiostaan, tautiin sairastumiseen tarvittava altistuminen on suurta ja rutto on levinnyt laajalle alueelle.
Mustahäntäiset preeriakoirat ovat sateenvarjo- ja avainlajeja: niillä on tärkeä rooli ruohikkoalueiden ekosysteemissä, ja niiden paikkakunnat elättävät useita muita lajeja. Biologit laskevat yli 170 selkärankaista lajia, joihin preeriakoirien olemassaolo vaikuttaa. Yksi niiden tärkeistä tehtävistä on maaperän kääntäminen; ne nostavat tunnelimaata pintaan ja tunnelit ilmastavat maata. Tutkijat ovat oppineet, että niiden leikkaama ruoho stimuloi uutta kasvua ja voi parantaa muiden laiduntajien rehun laatua ja monimuotoisuutta. Niiden on kuitenkin tiedetty tappavan ruohon kaupunkiensa keskellä, jolloin leveälehtiset yrtit ja pienet pensaat pääsevät siirtymään sinne.
Muut tutkimukset osoittavat, että luonnonvaraisen eläimistön tiheys on yleensä suurempi preeriakoirakaupunkien ympärillä kuin preeria-alueilla, joilla ei ole preeriakoiria. Muita lajeja ovat muun muassa hiiret, nopeat ketut ja petolinnut. Pöllöt ja preerian kalkkarokäärmeet käyttävät koloja suojana. Pronssipeurat hakeutuvat kaupunkien keskellä oleviin leveälehtisiin pensaisiin. Tutkijat ovat itse asiassa havainneet, että preeriakoirat ovat usein liikalaiduntamisen oire, sillä ne voivat paremmin liikalaidunnetuilla alueilla. Ennen länsimaiden laajenemista preeriakoirat seurasivat biisonilaumoja ja perustivat kaupunkejaan maille, jotka oli laidunnettu maan tasalle.
Valitettavasti sylväsrutto pystyy tappamaan yli 99 prosenttia preeriakoirien yhdyskunnista, mikä tekee tartunnan saaneiden populaatioiden elpymisestä uskomattoman vaikeaa. Tästä huolimatta populaatioiden kokonaismäärät pysyvät korkeina. Preeriakoirayhdyskuntia on useilla suojelualueilla, joilla metsästys/hävittämistoimenpiteet eivät ole sallittuja. Tarvitaan lisää populaatiotutkimuksia ja inventointeja sekä tutkimusta preeriakoirien genetiikasta ja kolonioiden välisestä elinympäristön pirstoutumisesta.
- Tue Smithsonianin kansallisen eläintarhan ja suojelubiologian instituutin kaltaisia organisaatioita, jotka tutkivat parempia tapoja suojella ja hoitaa tätä eläintä ja muita uhanalaisia lajeja. Harkitse ajan, rahan tai tavaroiden lahjoittamista.
- Jaa tämän eläimen tarina muiden kanssa. Pelkästään tietoisuuden lisääminen tästä lajista voi edistää sen yleistä suojelua.