Maasta, josta tulisi Wisconsin, tuli osa Yhdysvaltoja vuonna 1783, ja se organisoitiin ensimmäisen kerran Luoteisjärjestyksen nojalla. Siitä tuli Wisconsinin territorio vuonna 1836 ja Wisconsinin osavaltio 29. toukokuuta 1848. 1850-luvulla saapui runsaasti eurooppalaisia maahanmuuttajia.
Wisconsiniin muodostui 1860-luvulla raittiuden ja äänioikeuden puolesta toimivia naisten oikeuksia ajavia ryhmiä. Wisconsinin naisten äänioikeusyhdistys perustettiin vuonna 1869. Vuosina 1855 ja 1867 esitettiin äänioikeuslakiehdotuksia, mutta molemmat epäonnistuivat. Osavaltion lainsäätäjä kuitenkin hyväksyi vuonna 1869 lain, jonka mukaan naiset saivat asettua ehdolle koululautakuntiin ja vaaleilla valittaviin kouluvirkoihin. Vasta 10. kesäkuuta 1919 Wisconsinista tuli ensimmäinen osavaltio, joka ratifioi 19. lisäyksen, jolla naisille myönnettiin kansallinen äänioikeus.
Wisconsinia hallitsivat ensimmäisellä vuosisadalla vuorotellen republikaaninen ja edistysmielinen puolue, mutta sen jälkeen se on ollut kilpailukykyisempi. Republikaanit saivat enemmistön molemmissa parlamenteissa vuoden 1995 vaalikaudella, ensimmäisen kerran sitten vuoden 1969. Vuonna 2009 demokraattinen puolue sai molempien talojen hallinnan ensimmäistä kertaa sitten vuoden 1993.
Tasavaltainen puolue sai molempien talojen hallinnan takaisin vuonna 2011. Kuvernööri Scott Walker allekirjoitti sen jälkeen uuden uudelleenjakosuunnitelman. Vuoden 2012 vaaleissa demokraatit saivat enemmistön äänistä, mutta republikaanit säilyttivät lainsäätäjän vallan ja saivat 60 paikkaa 99:stä edustajakokouksen paikasta. Wisconsinin vuoden 2016 vaaleissa republikaanit saivat suurimman enemmistönsä edustajakokouksessa sitten vuoden 1956.
21. marraskuuta 2016 Yhdysvaltain piirituomari Kenneth Francis Ripple, johon piirituomari Barbara Brandriff Crabb yhtyi, katsoi, että republikaanien vuoden 2011 vaalipiirien uudelleenjako oli perustuslain vastaista puoluekohtaista gerrymanderingia piirituomari William C. Griesbachin eriävän mielipiteen ohi. Tuomioistuin katsoi, että vuoden 2011 uudelleenjakosuunnitelma loi kolme kertaa enemmän hukkaan heitettyjä ääniä kuin maassa keskimäärin, mikä rikkoi Yhdysvaltain perustuslain takuuta ”yksi mies, yksi ääni”.
Wisconsinin osavaltion vuoden 2018 parlamenttivaalit pidettiin tiistaina 6. marraskuuta 2018. Wisconsinin osavaltion kokouksen kaikki 99 paikkaa olivat ehdolla vaaleissa. Republikaaninen puolue säilytti enemmistön, joka sillä on ollut vuodesta 2011 lähtien, voittamalla 63 paikkaa, mikä merkitsi yhden paikan menetystä ja 44,75 % ääniosuutta.