En 1967, Lynn (Sagan) Margulis a proposé que les mitochondries, les plastes photosynthétiques et les cils ont été acquis par des procaryotes et ont évolué de manière symbiotique pour former des bactéries anaérobies, des bactéries photosynthétiques et finalement des algues. Bien que la majeure partie de cette théorie soit aujourd’hui bien acceptée, l’hypothèse selon laquelle les spirochètes endosymbiotiques ont évolué vers des flagelles et des cils eucaryotes, et les propositions suivantes d’une origine endosymbiotique d’autres organelles eucaryotes tels que les peroxysomes, les glyoxysomes, etc. n’ont pas été beaucoup acceptées, car les preuves suggèrent qu’ils sont dépourvus de génome et ne présentent pas de similitudes ultrastructurales avec les bactéries ou les archées. Néanmoins, l’idée qu’au cours des millénaires, les mitochondries, les plastes, les cellules procaryotes et eucaryotes et même les flagelles et les peroxysomes, en tant qu’endosymbiontes primaires ou secondaires, ont transféré une partie ou la totalité de leur propre ADN au noyau de la cellule hôte par un processus appelé « endogénosymbiose » (c’est-à-dire un transfert de gènes symbiotiques, comme l’internalisation de l’ADN de l’endosymbionte avec transfert latéral) a été récemment suggérée. Cette endogénosymbiose pourrait avoir lieu au cours de la transition évolutive de la communauté symbiotique en interaction, invoquée par Margulis, vers une cellule entièrement intégrée (procaryote ou eucaryote). Ce processus pourrait expliquer l’absence de preuves de la présence d’ADN dans les flagelles et les peroxysomes dont les ancêtres endosymbiontes, au cours de la longue évolution endogénosymbiotique, auraient pu transférer leur génome entier à la cellule hôte qui l’aurait ensuite intégré dans son propre génome, contrôlant directement son expression. De plus, l’hypothèse de l’endogénosymbiose pourrait être l’explication de la transition entre un monde d’ARN et un monde d’ADN et de certains cas de véritable évolution sympatrique d’espèces, apparemment inexplicables par les processus canoniques de spéciation. Ici, après une introduction à la base théorique de l’endogénosymbiose et une discussion des preuves empiriques de confirmation, je montre un résumé graphique de l’intégration entre cette théorie et les anciennes théories d’endosymbiose. La théorie de l’endosymbiose sérielle et l’endosymbiose secondaire sont fusionnées avec la théorie de l’endogénosymbiose dans une théorie symbiogénétique unifiée (UST).
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