Puteți utiliza SMART în două moduri diferite: normal sau genomic.Principala diferență constă în baza de date proteică de bază utilizată. În SMART normal, baza de date conține proteomul Swiss-Prot, SP-TrEMBL și proteomul Ensembl stabil. În SMART genomic, se utilizează numai proteomii din genomurile complet secvențiate; Ensembl pentru metazoare și Swiss-Prot pentru restul. Lista completă a genomurilor din Genomic SMART este disponibilă aici.
Baza de date cu proteine din Normal SMART are o redundanță semnificativă, chiar dacă proteinele identice sunt eliminate. Dacă utilizați SMART pentru a explora arhitecturi de domenii sau doriți să găsiți numărul exact de domenii în diverse genomuri, luați în considerare trecerea la modul Genomic. Numerele din paginile de adnotare a domeniilor vor fi mai exacte și nu vor exista multe fragmente de proteine care corespund aceleiași gene în rezultatele interogării arhitecturii. Amintiți-vă totuși că explorați un set limitat de genomuri.
Sunt utilizate diferite scheme de culori pentru a identifica cu ușurință modul în care vă aflați.
Modul normal | Modul genomic |
Click pe imaginile de mai sus pentru a selecta modul dvs. implicit.
Informațiile despre modul selectat sunt stocate într-un cookie al browserului. Dacă, din orice motiv, nu doriți/nu puteți utiliza cookie-uri, accesați SMART prin această pagină.
.