Hi, antarcticUrbanite, ezek remek kérdések!
1. Az azonos tulajdonságú aminosavak közötti különbség az R-csoportjaik molekuláris szerkezete és az, hogy ez hogyan befolyásolja más aminosavak kölcsönhatási képességét velük.
Az alanin, a leucin és a fenilalanin például mind nem poláris, hidrofób aminosavak. Minden R-csoportjuk teljes egészében szénből és hidrogénből áll. Azonban különböző méretűek és alakúak. Ez azt jelenti, hogy más aminosavak másképp tudnak köréjük hajtogatni. Tegyük fel, hogy egy fehérje elsődleges szerkezetében általában egy alanin van egy bizonyos helyen. Az alanin R-csoportja hidrofób és meglehetősen kicsi, így valószínű, hogy a fehérje más részei köré hajtódnának. Ha az alanint leucinnal helyettesítenénk, a fehérje más részei nehezebben tudnának a szokásos helyükre hajtogatni körülötte, mivel a leucin egy kicsit nagyobb, mint az alanin. Ha pedig az alanint fenilalaninnal helyettesítenénk, akkor várhatóan még jobban megzavarnánk a fehérje normális összecsukódását az adott pont körül, mivel a fenilalanin sokkal nagyobb, mint az alanin. Ez tehát igen jelentős hatással lehet a fehérje teljes harmadlagos szerkezetére és működésére.
2. Az, hogy a fehérjék hogyan hajtódnak össze harmadlagos szerkezetükbe, egy nagyon bonyolult rejtély, amelyet a tudósok még mindig próbálnak megfejteni. Jelenleg egy fehérje elsődleges szerkezetének ismeretében még mindig nem tudjuk nagyrészt, hogyan fog 3 dimenziós fehérjévé összecsukódni. Bizonyos típusú aminosav-szekvenciák azonban arra utalhatnak, hogy a fehérje egy adott doménje olyan másodlagos szerkezetekbe hajtogatódik, mint az alfa-hélixek és béta-lapok. Az ismert és ismeretlen harmadlagos szerkezetű fehérjék részeinek elsődleges szerkezete közötti hasonlóságokat arra is felhasználjuk, hogy megjósoljuk vagy megalapozottan kitaláljuk az ismeretlen fehérje részeinek harmadlagos szerkezetét. Tehát a rövid válasz a kérdésére az, hogy igen, bár jelenleg nehéz új, kívánt szerkezetű vagy funkciójú fehérjéket tervezni.
…Ez azt jelenti, hogy egyre közelebb kerülünk ahhoz, hogy képesek legyünk erre. Itt van egy nemrégiben megjelent cikk a New York Times-ból ebben a témában, amit talán érdekesnek találsz:
https://www.nytimes.com/2017/12/26/scie … baker.html
Sok sikert, és szólj, ha tudok segíteni a további magyarázatokban!
Tudd meg, ha bármiben tudok segíteni!