器官は、個々の組織の種類の範囲を超えた機能を実行するために働く2〜4種類の組織で構成される構造体である。 さらに複雑な機能を果たすために協力的に働く関連臓器の集合が臓器系を構成している。
臓器にはさまざまな形態がある。 上皮、結合組織、神経組織、平滑筋組織で構成される胃は、よく知られた例である。 骨も臓器です。骨は主として骨組織でできていますが、骨には神経が、空洞には繊維組織が、血管には筋肉と上皮組織が膨大に供給されています。 皮膚（integument）は、血管や分泌腺などの付属構造物が豊富な厚い結合組織（真皮）の上に、上皮（表皮）が重なっている器官である。
外皮の中の腺でさえも器官とみなすことができる。どんな腺も、主として分泌性の上皮で、支持と保護のための結合組織に囲まれている。 同様に、これらの器官内の血管や神経は、それ自体が器官です。
この「器官の中の器官」というモチーフは感覚器官にも表れています。 たとえば眼球の中には網膜という器官があり、神経組織と上皮組織が結合して、眼球に入る光を感知している。