Ficheiro Fasta

Os dados da sequência contêm sequências de resíduos sem dados estruturais. A derivação e precisão de tais arquivos é assunto de pesquisa, mas os formatos tendem a ser simples.

*.fasta

Objetivo da aplicação

Informação de sequência gerada pelo pacote de alinhamento de sequência FASTA.

Formato

O formato do FASTA é descrito aqui

Exemplo

Neste exemplo 2ptl_ é o identificador (usando o nome do PDB). 1-120 descreve o intervalo de resíduos que o arquivo contém: Exemplo B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Algumas aplicações, incluindo stepwise e rna_denovo, tomam várias chains como entrada, e permitem que chain e resíduos sejam especificados em tags como C:10-121 nos cabeçalhos FASTA.

Veja Também

• Lista de tipos de arquivo: Lista de tipos de arquivo usados em Rosetta
• Rosetta Basics: A página inicial do Rosetta Basics
• Visão geral das opções: Visão geral das opções de linha de comando da Rosetta
• Glossário: Breves definições dos termos Rosetta
• RosettaEncyclopedia: Descrições detalhadas de conceitos adicionais em Rosetta.
• Visão geral da Rosetta: Visão geral dos principais conceitos em Rosetta
• Documentação de aplicação: Links para a documentação de uma variedade de aplicações da Rosetta