Fișier Fasta

Datele de secvență conțin secvențe de reziduuri fără date structurale. Derivarea și acuratețea acestor fișiere face obiectul cercetărilor, dar formatele tind să fie simple.

*.fasta

Scopul aplicației

Informații de secvență generate de pachetul de aliniere a secvențelor FASTA.

Format

Formatele FASTA sunt descrise aici

Exemplu

În acest exemplu, 2ptl_ este identificatorul (folosind numele din PDB). 1-120 descrie intervalul de reziduuri pe care îl conține fișierul. : Exemplul B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Câteva aplicații, inclusiv stepwise și rna_denovo, iau mai multe lanțuri ca intrare și permit ca lanțul și reziduurile să fie specificate în etichete precum C:10-121 în anteturile FASTA.

Vezi și

• Lista tipurilor de fișiere: Lista tipurilor de fișiere utilizate în Rosetta
• Rosetta Basics: Pagina de pornire Rosetta Basics
• Prezentare generală a opțiunilor: Prezentare generală a opțiunilor din linia de comandă Rosetta
• Glosar: Scurte definiții ale termenilor Rosetta
• RosettaEncyclopedia: Descrieri detaliate ale unor concepte suplimentare din Rosetta.
• Rosetta overview: Prezentare generală a conceptelor majore din Rosetta
• Documentația aplicației: Link-uri către documentația pentru o varietate de aplicații Rosetta

.