Även om Pap-testerna har möjliggjort tidig upptäckt av premaligna lesioner har införandet av nya uppsamlingsanordningar avsevärt förbättrat upptäckten av lesioner som är dolda i den endocervikala kanalen, såsom adenocarcinom in situ (AIS). Termen ”atypiska körtelceller av obestämd betydelse” (AGUS) introducerades vid Bethesda-konferensen 1988 och definierades som morfologiska förändringar i körtelceller utöver dem som tyder på den godartade reaktiva processen, men som är otillräckliga för att ställa diagnosen adenocarcinom in situ (AIS). I det nya Bethesda-systemet från 2001 har termen tagits bort och ersatts med termen ”atypiska körtelceller” (AGC), med följande underklassificeringar: inte specificerat på annat sätt (NOS), gynnsam neoplasi, endocervikal AIS och adenokarcinom. Risken för premalign eller malign sjukdom i samband med kategorin AGC gynnar neoplasi är betydligt högre än i kategorin AGC NOS (96 % respektive 9-41 %). Patienter som diagnostiseras med AGC NOS eller AGC gynnar neoplasi kommer att behöva kolposkopi, endocervikal provtagning och, för patienter över 35 år, endometrialbiopsi. Om alla dessa tester är negativa bör Pap-testet upprepas med 4-6 månaders mellanrum tills 4 på varandra följande normala tester har erhållits. Positiva resultat på ett av testerna kräver behandling enligt ASCCP:s riktlinjer. Diagnosen AGC favor neoplasi kräver också cervikal konisering och/eller andra tester, eftersom förekomsten av premaligna eller maligna lesioner hos patienter med denna diagnos är hög. HPV-testernas roll i denna situation är för närvarande okänd.