Soubor Fasta

Sekvenční data obsahují sekvence zbytků bez strukturních dat. Odvození a přesnost těchto souborů je předmětem výzkumu, ale formáty bývají jednoduché.

*.fasta

Účel použití

Sekvenční informace generované balíčkem pro zarovnávání sekvencí FASTA.

Formát

Formát FASTA je popsán zde

Příklad

V tomto příkladu je identifikátorem 2ptl_ (pomocí názvu PDB). 1-120 popisuje rozsah zbytků, které soubor obsahuje : Příklad B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Některé aplikace, včetně stepwise a rna_denovo, berou jako vstup několik řetězců a umožňují, aby řetězce a rezidua byly specifikovány ve značkách jako C:10-121 v hlavičkách FASTA.

Viz také

• Seznam typů souborů: Seznam typů souborů používaných v Rosettě
• Základy Rosetty: Přehled možností: Domovská stránka Rosetta Basics
• Přehled možností: Přehled možností příkazového řádku Rosetty
• Slovníček: Stručné definice pojmů Rosetty
• RosettaEncyklopedie:
• Přehled Rosetty: Podrobné popisy dalších pojmů v Rosettě: Přehled hlavních pojmů v Rosettě
• Aplikační dokumentace: Odkazy na dokumentaci k různým aplikacím Rosetty

.