Universe
La version actuelle de R disponible lorsqu’une nouvelle version d’Ubuntu est publiée est toujours disponible dans le dépôt universe. Pour installer R:
sudo apt-get install r-base r-base-dev Ceci installera R, les paquets recommandés et les fichiers nécessaires pour installer de nombreux paquets supplémentaires (mais pas tous) à partir de R en utilisant install.packages("foo"). Les paquets R trouvés dans le dépôt universe ne sont pas mis à jour lorsque de nouvelles versions de R ou des paquets recommandés sont publiés.
CRAN
CRAN a des versions actuelles de R et des paquets recommandés disponibles pour toutes les versions actuellement supportées d’Ubuntu. Des instructions détaillées pour ajouter les dépôts CRAN peuvent être trouvées ici. La première étape consiste à ajouter la clé de sécurité:
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9 Puis vous devez ajouter le dépôt CRAN à la fin de /etc/apt/sources.list:
deb http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu precise/ L’adresse web du CRAN peut être remplacée par un <a href= »deb http:///bin/linux/ubuntu precise/ »>mirror local et le precise/ doit être remplacé par la version d’Ubuntu que vous utilisez. R peut alors être installé :
sudo apt-get update sudo apt-get install r-base r-base-dev Les paquets sur CRAN sont mis à jour régulièrement et les versions les plus récentes seront généralement disponibles quelques jours après leur publication. Un avantage de l’utilisation du dépôt CRAN est que les anciennes versions des paquets sont disponibles. Pour installer une ancienne version d’un paquet, il faut l’épingler. Les instructions pour l’épinglage sont différentes pour apt-get et synaptic et les détails peuvent être trouvés ici.
Launchpad PPA
Les paquets pour le dépôt CRAN sont construits sur un PPA Launchpad appelé RutteR. Il est possible d’utiliser le PPA lui-même, qui comprend quelques paquets de plus que le dépôt CRAN (JAGS et les paquets connexes, par exemple). L’installation du PPA via apt est très simple:
sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter sudo apt-get update sudo apt-get install r-base r-base-dev Le PPA est mis à jour un peu plus rapidement que le dépôt CRAN, mais les anciens paquets ne sont pas disponibles.
Si vous avez des questions sur les dépôts CRAN ou PPA, veuillez envoyer un courriel au mainteneur Michael Rutter.