Fasta File

I dati di sequenza contengono sequenze di residui senza dati strutturali. La derivazione e l’accuratezza di tali file è oggetto di ricerca, ma i formati tendono ad essere semplici.

*.fasta

Scopo dell’applicazione

Informazioni sulle sequenze generate dal pacchetto di allineamento delle sequenze FASTA.

Formato

Il formato di FASTA è descritto qui

Esempio

In questo esempio 2ptl_ è l’identificatore (utilizzando il nome del PDB). 1-120 descrive la gamma di residui che il file contiene. : Esempio B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Alcune applicazioni, tra cui stepwise e rna_denovo, prendono diverse catene come input, e permettono di specificare la catena e i residui in tag come C:10-121 nelle intestazioni FASTA.

Vedi anche

• Elenco tipi di file: Elenco dei tipi di file usati in Rosetta
• Rosetta Basics: La home page di Rosetta Basics
• Panoramica delle opzioni: Panoramica delle opzioni della riga di comando di Rosetta
• Glossario: Brevi definizioni dei termini di Rosetta
• RosettaEncyclopedia: Descrizioni dettagliate di ulteriori concetti in Rosetta.
• Panoramica di Rosetta: Panoramica dei principali concetti di Rosetta
• Documentazione delle applicazioni: Link alla documentazione per una varietà di applicazioni Rosetta