Fasta File

Dane o sekwencjach zawierają sekwencje reszt bez danych strukturalnych. Pochodzenie i dokładność takich plików jest przedmiotem badań, ale formaty są zazwyczaj proste.

*.fasta

Cel zastosowania

Informacje o sekwencjach generowane przez pakiet wyrównywania sekwencji FASTA.

Format

Format FASTA jest opisany tutaj

Przykład

W tym przykładzie 2ptl_ jest identyfikatorem (używając nazwy PDB). 1-120 opisuje zakres reszt, które zawiera plik: Przykład B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Niektóre aplikacje, w tym stepwise i rna_denovo, przyjmują kilka łańcuchów jako dane wejściowe i pozwalają na określenie łańcucha i reszt w znacznikach takich jak C:10-121 w nagłówkach FASTA.

Zobacz także

• Lista typów plików: Lista typów plików używanych w Rosetcie
• Rosetta Basics: Strona domowa Rosetta Basics
• Przegląd opcji: Przegląd opcji wiersza poleceń Rosetty
• Słowniczek: Krótkie definicje terminów z Rosetty
• RosettaEncyklopedia: Szczegółowe opisy dodatkowych pojęć w Rosetta.
• Przegląd Rosetty: Przegląd głównych pojęć w Rosetta
• Dokumentacja aplikacji: Linki do dokumentacji dla różnych aplikacji Rosetty

.