Re-epitelialisation: advancing epithelium frontier during wound healing

author
25 minutes, 27 seconds Read

Introduction

Dorosła skóra składa się z trzech warstw: naskórka i skóry właściwej oddzielonych błoną podstawną. Kiedy dochodzi do głębokiego urazu, który niszczy część skóry właściwej, musi ona zostać szybko naprawiona, aby przywrócić barierę ochronną. Gojenie się ran in vivo jest złożonym procesem naprawczym regulowanym przez szlaki wewnątrz- i międzykomórkowe. Aby przywrócić integralność skóry, proces ten przebiega w czterech następujących po sobie, ale nakładających się na siebie etapach: krzepnięcie, zapalenie, reepitelializacja i remodelowanie. Bezpośrednio po urazie tworzy się skrzep składający się głównie z włókien fibryny i płytek krwi, który zasklepia ranę (etap 1). Następnie w ciągu następnych 2-10 dni (etap 2) skrzep jest stale naciekany przez komórki zapalne, które oczyszczają go z resztek i uwalniają czynniki chemiczne, takie jak czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego i transformujący czynnik wzrostu-beta. Gdy gradient chemiczny zostanie ustalony, różne komórki są rekrutowane do tworzenia nowej tkanki (etap 3). Z jednej strony, neowaskularyzacja i fibroblasty (odkładające kolagen) rekrutują się w skórze właściwej, przekształcając skrzep w tkankę ziarninową, która odżywczo i fizycznie wspomaga naprawę górnych warstw. Z drugiej strony, keratynocyty migrują i proliferują na brzegu rany, aby rozszerzyć nowo utworzony dywan nabłonkowy złożony z kilku warstw komórek naskórka. Proces ten nazywany jest reepitelializacją i trwa od dwóch do trzech tygodni. Pod koniec etapu 3, miofibroblasty przekształcone z fibroblastów kurczą się i próbują zbliżyć brzegi rany do siebie. Zanikają one w wyniku apoptozy w skórze właściwej. Remodeling (etap 4) trwa przez miesiące, a nawet lata, aby przywrócić homoeostazę prawidłowej skóry. Normalna struktura anatomiczna nie zostaje jednak w pełni przywrócona, a z tkanki ziarninowej powstaje blizna. O ile dotyczy to dużych ran u dorosłych ludzi, o tyle te u ludzkich embrionów mogą być doskonale zamknięte, czego przyczyny nie są w pełni zrozumiałe. Co ciekawe, uważa się, że tworzenie się blizny jest ewolucyjnym poświęceniem w celu osiągnięcia szybkiego zamknięcia rany, a wskazuje na to intensywna i nadmiarowa odpowiedź zapalna, która pośredniczy w systematycznych zachowaniach komórek podczas reepitelializacji poprzez uwalnianie sygnałów chemicznych. We wszystkich przypadkach ostateczna blizna jest wynikiem współdziałania komórek i mikrośrodowiska poprzez czynniki fizyczne i chemiczne podczas czterech etapów.

Tutaj skupiamy się na reepitelializacji, kiedy keratynocyty, komórki dominujące w naskórku, odłączają się od błony podstawnej, migrują w kierunku brzegu rany i proliferują, napędzane przez morfogeny w tkance ziarninowej. Bardzo staranne eksperymenty migracji nabłonka in vitro zostały ostatnio przeprowadzone przez kilka grup. Przeprowadzane na stałym podłożu, obejmują one postępującą monowarstwę, motywowaną zbiorowym zachowaniem komórek poprzez migrację, generowanie sił i reorganizację cytoszkieletu komórkowego na brzegu rany. Wyniki wskazują na nieintuicyjny sposób osiągania przez komórki wytrzymałości podczas naprawy, gdzie chemotaksja nie wydaje się być decydująca dla globalnej migracji komórek w warunkach in vitro. Niemniej jednak, ze względu na obfitość sygnałów morfogenicznych uwalnianych w ranie in vivo w porównaniu z eksperymentami in vitro, chemotaksja dominuje w kolektywnym zachowaniu komórek podczas procesu gojenia się rany. Bliżej gojenia ran in vivo (ryc. 1a(i)(ii)), odtworzono sztuczną rogówkę (ryc. 1b(i)(ii)) poprzez wprowadzenie komórek nabłonkowych, fibroblastów i czynników wzrostu do trójwymiarowej płytki Petriego. Co ciekawe, wszystkie te prace dotyczą geometrii kołowej, a nie liniowego cięcia wykonanego we wcześniejszych eksperymentach . Chociaż dobrze kontrolowane, nie jest jasne, czy systemy te przedstawiają całą złożoność gojenia ran in vivo. Niemniej jednak, zarówno eksperymenty in vivo jak i in vitro prezentują nieuporządkowaną ewolucję granic, co wskazuje na możliwą uniwersalną nieregularność spowodowaną chemotaksją (rysunek 1).

Rysunek 1. Proces zamykania po biopsji dziurkowanej o średnicy 5 mm na normalnej skórze myszy typu dzikiego (a(i), z , copyright with permission) i biopsji dziurkowanej o średnicy 6 mm na sztucznej tkance rogówki (b(i), z , copyright with permission). Na obu widać falistą granicę w miarę zamykania się rany. Zdjęcia zrobione 3 dni (dla skóry myszy typu dzikiego) i 2 dni (dla tkanki rogówki) po nakłuciu są pokazane odpowiednio w a(ii) i b(ii).

W tej pracy opisujemy reepitelizację poprzez rozważenie okrągłego otworu w tkance, adaptując ostatni dynamiczny model chemotaktycznej migracji napędzanej przez morfogenetyczne gradienty. Będąc ciągłym, model ten opisuje tkankę w skali większej niż rozmiar komórek, ale mniejszej niż rozmiar otworu. Nie rozróżniamy tu gatunków komórek ani kategorii chemoatraktantów. Ten ostatni jest stale dostarczany przez napływający strumień z trzeciego wymiaru normalnego do warstwy nabłonkowej i pobierany przez receptory komórkowe. Jak pokazano w , cienkość ruchomej warstwy przekształca trójwymiarowy proces w model dwuwymiarowy, gdzie zlokalizowana zmiana grubości na granicy przyczynia się do powstania napięcia T. Dodatkowo zakładamy, że pomiędzy ruchomą warstwą a podłożem istnieje silne tarcie lepkie, co pozwala na zapisanie prawa Darcy’ego dla pola średniej prędkości wewnątrz tkanki, podczas gdy oddziaływania komórka-komórka i mitoza są przekształcone w warunki brzegowe interfejsu w granicy ostrego interfejsu. Najpierw przedstawiamy model fizyczny, a następnie analityczne rozwiązanie dające jednoznaczne rozwiązanie dla geometrii kołowej i badanie jego stabilności. W przypadku liniowej granicy pokazano, że przy małych prędkościach pojawia się długofalowa niestabilność spowodowana trybem Goldstone’a (translacyjna niezmienniczość), której samo napięcie powierzchniowe nie jest w stanie powstrzymać. Intuicyjnie, można oczekiwać, że zniknie ona dla małych otworów, gdy efekt napięcia powierzchniowego będzie się nasilał. Przeciwnie, jak w przypadku eksperymentów in vitro, większe otwory mogą wykazywać niestabilność konturu prowadzącą do dynamicznych zachowań, które staramy się przewidzieć. Aby wyjść poza analizę stabilności, zależny od czasu problem swobodnych granic wymaga metod numerycznych zdolnych do rozwiązywania równań na ewoluujących domenach. Postanowiliśmy rozwiązać nasz problem za pomocą metod zbiorów poziomów, opracowanych po raz pierwszy w latach 80. przez Oshera & Sethiana, które są w stanie automatycznie śledzić ruchome interfejsy i zmiany topologiczne i zostały z powodzeniem zastosowane do problemów takich jak interakcje ciecz-gaz, przetwarzanie obrazów i wzrost guza. Ze względu na charakter naszego problemu teoretycznego, wybieramy metodologię opracowaną dla wzrostu guza. W dalszej części przedstawiamy najpierw model, wprowadzając najbardziej istotne parametry fizyczne, następnie analizę dla słabej niestabilności amplitudowej, a na końcu metody numeryczne i symulacje dla ostatecznego stanu zamknięcia.

Model

Rozważamy okrągły otwór Ω w dwuwymiarowej populacji komórek o gęstości ρ zanurzonych w środowisku morfogenetycznym (rysunek 2). Komórki migrują w górę gradientu morfogenów, przy czym strumień chemotaktyczny jest proporcjonalny do gradientu stężenia morfogenów , a Λc jest stałą ruchliwości. Repartycja morfogenów wewnątrz i na zewnątrz otworu Ω jest alimentowana przez źródła pochodzące z dołu. Mitoza zachodzi tylko na granicy, a zamknięcie następuje głównie przez migrację. Bilans masy dla populacji komórek wynosi wtedy

2.1

Rysunek 2. Schematyczny opis: Ω to rana (skrzep → tkanka ziarninowa), w której uwalniane są chemoatraktanty, a Ωc to ruchome kontinuum nabłonkowe. Gradient ciśnienia hydrostatycznego w Ωc jest napędzany przez chemotaksję. Proliferacja jest ograniczona na granicy (kontur w kolorze czarnym i powiększony na szaro).

Zaniedbując wzrost objętościowy (γ = 0) w tkance z wyjątkiem peryferii, gęstość komórek jest stała i ρ = ρ0. Równanie (2.1) upraszcza się do i daje, że normalna prędkość frontu jest wprost proporcjonalna do normalnego gradientu stężenia. Przy ekstremalnie małych prędkościach migracja komórek spełnia prawo Darcy’ego , gdzie Mp jest współczynnikiem porowatości równym kwadratowi wysokości nabłonka podzielonemu przez współczynnik tarcia. Jak pokazano w , prawo to jest wydedukowane w tkankach, gdy tarcie między fazami lub tarcie o podłoże równoważy hydrostatyczną część naprężeń sprężystych działających na komórki. Rana zaburza stan homoeostazy otoczenia i źródło morfogenów będzie próbowało przywrócić optymalną wartość równowagi w szczelinie c0. Przyjmując to stężenie jako jednostkę stężenia morfogenu (co daje ), τc czas wchłaniania jako jednostki czasu, Le jako jednostkę długości (gdzie , De jest współczynnikiem dyfuzji wewnątrz nabłonka), otrzymujemy

2,2

z indeksem h lub e odnoszącym się do domeny wewnętrznej (otwór) lub zewnętrznej (nabłonek). δ = Dh/De reprezentuje stosunek współczynnika dyfuzji w otworze Dh do tkanki De, jest on większy od 1, a α podaje siłę strumienia poprzecznego, który utrzymuje poziom morfogenu wewnątrz otworu. Ze względu na względną powolność migracji komórek, w równaniu (2.2) pomijamy zależność od czasu. Przyjęcie De/Mp jako jednostki ciśnienia upraszcza prawo Darcy’ego do postaci , gdzie dla uproszczenia zachowujemy tę samą notację dla p i v. Z równania bilansu masy (2.1) otrzymujemy następujące równanie Laplace’a sprzęgające nieznane ciśnienie p z koncentracją chemoatraktanta c:

2.3

Otrzymujemy więc , gdzie ϕ jest funkcją holomorficzną spełniającą Δϕ = 0. Na koniec musimy zwrócić szczególną uwagę na warunki brzegowe interfejsu. Dla równania (2.2) dotyczą one ciągłości koncentracji i nieciągłości strumienia z powodu zużycia morfogenu przez mitozę na granicy (dla demonstracji, patrz ):

2.4

gdzie N jest normalną zewnętrzną. Γ2 jest tempem absorpcji ograniczonym na granicy omówionej poniżej wraz z tempami mitozy Γ1 i na granicy. Kapilarność utrwala skok ciśnienia na granicy

2.5

, co daje warunek swobodnej granicy z uwzględnieniem efektu geometrycznego, gdzie jest lokalnym promieniem krzywizny. jest równy promieniowi, jeśli geometria jest okręgiem. Rozważa on jednak efekt lokalny w małej skali długości, gdy granica jest zaburzona. Jednocześnie prędkość interfejsu różni się od prędkości nabłonka v przez proliferację komórek na granicy i otrzymujemy

2.6

gdzie Γ1 jest tempem mitozy, a σ liczbą kapilar związaną z napięciem T na granicy, więc Gojenie ran in vivo jest zdominowane przez dwuwymiarową migrację, a morfogenami prawdopodobnie nie są składniki odżywcze, więc Γ2 znika, a Γ1c musi być zastąpione przez , jeśli rozważamy również mitozę bez ilościowego wpływu stężeń składników odżywczych. Liczba kapilar σ może być związana z aktywnością przewodu aktynowego (wiązki mikrofilamentów) w komórkach. Podczas gojenia ran embrionalnych, komórki brzegu wiod±cego mog± globalnie koordynować swoje przewody aktynowe, co generuje efekt na poziomie makroskopowym. Jednakże, to skoordynowane zachowanie jest tracone u dorosłych, więc efekt kabli aktynowych może działać tylko lokalnie. Przypomina to σ w naszym modelu, które nie jest efektywne dla dużych ran. Rozważając układ równań (2.2) i (2.3) w połączeniu z zestawem warunków brzegowych (2.4), (2.5) i (2.6) pokazujemy, że migracja napędzana chemotaksją jest w istocie problemem o swobodnych granicach, obejmującym kilka parametrów reprezentujących złożoność biologiczną, a badanie prostych przypadków, na przykład okrągłego zamknięcia, może pomóc w zrozumieniu ich roli. Przedstawiamy więc najpierw wyniki analityczne dla otworu pozostającego kolistym przez cały czas, a następnie jego stabilność.

Wyniki

3.1. Regularne zamknięcie kołowe

W przybliżeniu quasi-statycznym równanie (2.2) może być rozwiązane analitycznie i daje

3.1

I0 (resp. K0) będące zmodyfikowaną funkcją Bessela zerowego rzędu, regularną w punkcie r = 0 (resp. r → ∞). Równanie (3.1) uwzględnia ciągłość na granicy faz, przy czym A jest dane ciągłością strumienia i ma postać

3.2

z następującą definicją dla (stosunek dwóch kolejnych funkcji Bessela) i równoważną dla Ciśnienie P0 wewnątrz nabłonka staje się

3.3

Wykorzystujemy prawo Laplace’a do ustalenia nieznanego stopnia swobody. Holomorficzna funkcja ϕ, proporcjonalna do log(r), reprezentuje możliwą siłę napędową, która pojawia się na interfejsie (tj. tzw. kenotaksja zdefiniowana w ). Rzeczywiście, nawet przy braku morfogenów obserwuje się migrację nabłonka in vitro na stałym podłożu, być może dzięki reorganizacji cytoszkieletu komórkowego na granicy rany. Zauważmy, że model pozostaje poprawny, je¶li odrzucimy chemotaksję, pod warunkiem, że zmienimy definicję jednostek długo¶ci i czasu. Ponadto, C0 i P0 są zależne od czasu poprzez R(t). Dla uproszczenia, porzucamy zależność od czasu Prędkość zamknięcia wydedukowana z równania (3.5) wynosi wtedy

3.4

Prędkość zamykania jest stała dla dużych otworów i jest wykładniczo mała , gdy promień R staje się maleńki, jeśli ograniczyć się do migracji chemotatycznej i proliferacji. Tak więc promień dużego otworu zaczyna się od liniowego spadku w czasie, ale całkowite zamknięcie zajmie nieskończony czas na całkowite osiągnięcie. Dla małych otworów, chemotaksja staje się subdominująca w porównaniu z kenotaksją Ain na interfejsie, która kontroluje dynamikę zamykania, a promień spełnia dyfuzyjne prawo w t1/2 . Rysunek 3 przedstawia w funkcji R dla różnych wartości α, δ i Ain/Λ, a §4 zawiera dyskusję parametrów.

Rysunek 3. Prędkość zamykania w funkcji R, zmienna (a) δ, (b) α i (c) Dla dużego R prędkość jest stała. Prędkość zbiega do 0, gdy R przechodzi do 0, z wyjątkiem rozważenia efektu Ain(>0) (c).

3.2. Utrata okrągłości

Jednakże równanie (3.4) jest ważne tylko wtedy, gdy zachowany jest kontur kołowy. Dlatego przeprowadzamy liniową analizę stabilności dla dużych ran (Ain ∼ 0) zakładając małą harmoniczną perturbację dla promienia jako wywołującą zmiany na ciśnieniu P i polu koncentracji C tego samego rzędu ε w następujący sposób:

3.5

gdzie indeks dolny i oznacza albo wielkość względem otworu (h, 0 < r < R) albo względem naskórka (e, R < r < ∞). Chociaż wszystkie wielkości perturbacyjne zależą od wybranego trybu n, to liniowa analiza perturbacyjna traktuje te tryby niezależnie. Porzucamy więc indeks n i obliczamy perturbacyjne pola koncentracji ci(r) z równania (2.3)

3.6

natomiast perturbacyjne pole ciśnienia jest dane przez gdzie uwzględniamy tryby harmoniczne funkcji holomorficznej ϕ z B ustalonym prawem Laplace’a Dzięki słabości ε nasz układ równań, po linearyzacji, można rozwiązać analitycznie, a szybkość wzrostu trybu n odczytujemy

3.7

gdzie

Równanie (3.7) przedstawia zależność implicite dla Ωn, rozwiązywaną za pomocą technik iteracyjnych, a wartości dodatnie wskazują na tryby odpowiedzialne za destabilizację granicy kołowej w miarę postępu migracji. Wyniki są przedstawione dla różnych wartości Λ, α i δ, gdzie Ωn jest pokazane na rysunku 4. Dyskusja parametrów znajduje się w §4. Wyniki wskazują na niestabilność prowadzącą do odchylenia od okręgu w krótkim czasie, dla n aż do trybu krytycznego nc (ustalonego przez kapilarność). Dlatego symulacje numeryczne są niezbędne, aby wyjść poza analizę liniową i w pełni rozważyć nieliniowości.

Rysunek 4. Szybkość wzrostu Ωn w funkcji liczby falowej n zmieniającej (a) współczynnik ruchliwości Λ, (b) siłę morfogenu α i (c) stosunek współczynnika dyfuzji δ = Dh/De między raną a nabłonkiem.

3.3. Pełna dynamika i metody numeryczne

Dyskretyzujemy c w równaniu (2.2) i ciśnienie p w równaniu (2.3) na siatce kartezjańskiej w przestrzeni i implicite w czasie, używając nieliniowej adaptacyjnej metody iteracyjnej Gaussa-Seidela. Na granicy domeny narzucamy zarówno znikające wartości c, jak i normalny gradient p. Następnie szum jest dodawany na C = c + χ z Zaczynając od idealnego okręgu z R = 90, zamykanie rany jest śledzone przez metodę level-set opracowaną w gdzie funkcja skalarna Φ z opisuje ranę (Φ < 0), nabłonek (Φ > 0) i interfejs (Φ = 0). Normalna i krzywizna w równaniu (2.5) są obliczane za pomocą standardowej geometrii różniczkowej: i Φ jest aktualizowane przez zależność , gdzie Vext jest stałym rozszerzeniem Vint na interfejsie z równania (2.5) po gradiencie Zauważmy, że ta metoda symuluje idealne zamknięcie kołowe bez szumu. Zgodnie z naszymi wynikami, rana odchyla się od idealnego okręgu wkrótce po wzroście, jak pokazano na rysunkach 5 i 6 i w zgodzie z analizą stabilności.

Rysunek 5. Symulacja zamykania się rany. Obie zaczynają się od R = 90 (9 mm) i δ = 2. (a)(i) Pole koncentracji i (ii) ogólna ewolucja w czasie z Λ = 1 i α = 1; (b)(i) Pole koncentracji i (ii) ogólna ewolucja w czasie z Λ = 10 i α = 0.1. Dalsze wyjaśnienia znajdują się w tekście.

Rysunek 6. Symulacja zamknięcia rany w późnym stadium z dużą deformacją z δ = 2 (góra, po lewej) i δ = 1 (dół, po lewej). Po prawej: Monowarstwa komórek MDCK z raną wytworzoną przez cylindryczny filament z polidimetylosiloksanu po 10 (u góry) i 15 (na dole) godzinach . Początkowa średnica rany w eksperymencie wynosi 0,5 mm. Nieliniowa granica (czerwone strzałki) w późnym stadium łączy się i prowadzi do uszczypnięcia powierzchni rany (pomarańczowe strzałki) zarówno w symulacji jak i w eksperymencie.

Dyskusja i wnioski

W tym modelu jest kilka niezależnych parametrów. Niektóre z nich możemy ustalić z opublikowanymi danymi eksperymentalnymi (tabela 1). Nasza jednostka prędkości jest zgodna z prędkością zamykania rogówki (3 dni dla otworu o promieniu około 3 mm ) dając Λ ∼ 1 dla tego eksperymentu zgodnie z równaniem (3.2). Na rysunku 4 zmieniamy parametry α i δ, które są trudniejsze do oszacowania, a także Λ. Ze względu na duże rozmiary ran w praktyce, analiza stabilności liniowej daje zawsze niestabilność i wniosek ten jest odporny na zmiany parametrów. Wniosek ten potwierdzają w pełni nieliniowe symulacje w tym samym zakresie parametrów (rys. 5 i 6). W symulacjach, duże Λ (ok. 10, całkowity czas ok. 60) przyczynia się do szybszego zamykania w porównaniu z małym Λ (ok. 1, całkowity czas ok. 600). Typowy przykład procesu zamykania przy α = 1 i δ = 2 pokazano na rysunku 5a. Postępujący interfejs staje się falisty w miarę gojenia się rany; jednakże, gdy rana staje się mała, napięcie powierzchniowe ponownie stabilizuje ranę do kształtu ziemniaka, zgodnie z liniową analizą stabilności. To napięcie powierzchniowe może również odciąć ranę na mniejsze kawałki, jak pokazano na rysunku 5b(ii), rysunku 6 i w . To zdarzenie wymaga najpierw bardziej nieregularnego zamykania (czerwone strzałki na rycinie 6), kiedy stężenie chemoatraktantów jest mniej jednorodne, biorąc pod uwagę nieodpowiedni strumień poprzeczny (α = 0.1). Uszczypnięcie może nastąpić zarówno na pośrednim jak i końcowym etapie zamykania (żółte strzałki), co jest zgodne z obserwacjami na późnym etapie gojenia się rany na monowarstwie komórek MDCK (rysunek 6, po prawej), sugerując takie samo zachowanie w bardziej złożonych procesach gojenia się ran.

.

Tabela 1.Tabela parametrów.

parametr fizyczny wartość
współczynnik dyfuzji De 1 μm2 s-1
czas pobierania τc 2000 s
naprężenie powierzchniowe T 10-4 N m-1
współczynnik tarcia 10-9 N μm-3
jednostka długości 50 μm, obliczono
jednostkę prędkości 0.025 μm s-1, obliczona
liczba kapilarna σ 0.1, obliczona
siła chemoatrakcji α 0.1-10, oszacowana
współczynnik współczynnika dyfuzji δ 0.1-10, szacowany
prędkość komórek Λ 1-10, szacowany

W niniejszej pracy wykazaliśmy teoretycznie, że reepitelializacja rany daje niestabilność graniczną przy klinicznie realistycznych parametrach. Nasz model, napędzany przez chemotaksję, nie wprowadza innych aktywności komórek, które zamykają ranę na etapie końcowym. Przypuszczamy jednak, że ta chemotaktyczna niestabilność na granicy rany może wpływać na jakość ostatecznej naprawy. Podczas gojenia się ran embrionalnych, gdzie obserwuje się doskonałą rekonstrukcję, rana jest zamykana przez „sznurek strunowy”, który reprezentuje koordynację komórek brzegu wiodącego ułatwioną przez kabel aktyny . Mechanizm ten jest utracony w skórze dorosłej, gdzie rana zamykana jest przez pełzanie komórek (kilka warstw) po tkance ziarninowej. W porównaniu ze statycznym podłożem in vitro, tkanka ziarninowa ulega skurczeniu pod koniec reepitelializacji przez miofibroblasty. Rzeczywiście, celem tego jest zbliżenie krawędzi, co przypomina „sznurek do snopowiązałki”, ale skurcz tych komórek musi być zgodny z synchroniczną konstytucją materiału, co jest mechanicznie i systematycznie wyzwaniem .

Na koniec omawiamy nasz model w kontekście gojenia się rany skóry in vivo. Gdy rana sięga głęboko do skóry właściwej, co ma miejsce w przypadku większości ran, obie warstwy zachowują się inaczej podczas reepitelializacji. Głębokość rany wpływa na grubość dolnej warstwy, w której uwalniany jest chemoatraktant. Biorąc pod uwagę reepitelializację, gdzie tylko kilka warstw komórek staje się ruchliwych powyżej dolnych stosów, gdzie chemoatraktant jest uwalniany, głębokość rany przyczynia się matematycznie do siły poprzecznego strumienia chemoatraktantu α. Oprócz α, która może obejmować głębokość rany, geometria, rozmiar rany, jak również współczynnik dyfuzji δ są brane pod uwagę. W porównaniu z eksperymentami in vivo, proces gojenia się ran u ludzi może różnić się od tego u myszy doświadczalnych ze względu na inne właściwości biomechaniczne skóry. Jednakże, jeśli zamierzamy rozważyć problem in vivo z uwzględnieniem bioelastyczności, wyzwaniem nie są tylko różne składniki obu warstw, ale również fakt, że połączenie pomiędzy warstwą skórną i naskórkową jest wysoce nieuporządkowane nawet dla nienaruszonej skóry, jak pokazano w naszej poprzedniej pracy. Regularny wzór powinien być zdefiniowany w trzecim wymiarze, który uważamy za „normalny”. Ponadto, ponieważ tkanka rany ulega przebudowie podczas gojenia, parametry mechaniczne nie mogą być traktowane jako stałe, a relaksacja tkanki prawdopodobnie rozwija się w większej skali czasowej niż reepitelializacja. Istotnie, te procesy relaksacji powinny być również brane pod uwagę w przewidywaniu jakości ostatecznej naprawy. Zanim to nastąpi, nieregularność granicy rany napędzana przez chemotaksję powinna być rozważana jako składnik.

Podziękowania

Przyznajemy Pascalowi Silberzanowi i Olivierowi Cochet-Escartin za dyskusję i dostarczenie zdjęć z ich eksperymentów. Dziękujemy również Patrickowi Carrierowi za dyskusję.

Oświadczenie o finansowaniu

Ta praca była wspierana częściowo przez AAP Physique Cancer 2012.

Załącznik A. Implementacja numeryczna

Symulacja została wykonana na siatce kartezjańskiej 200 × 200 o rozmiarze siatki 10 μm. Ten problem o swobodnych granicach jest łatwy do zaimplementowania za pomocą metody level-set dzięki zależności od krzywizny w rozwiązywaniu ciśnienia w równaniu (2.5). Pełna metoda jest zaadaptowana z i ma rząd dokładności większy niż 1.5. Podczas gdy granica może być implicite podana przez zerowy kontur funkcji level-set Φ, krzywizna może być również łatwo obliczona. W każdym kroku czasowym dziedzina od Ωt do Ωt+Δt jest aktualizowana w następujący sposób:

– Rozwiązać równanie (2.2) z ustaloną dziedziną Ωt w stanie ustalonym z równaniem warunku swobodnego (2.4). Na granicy siatki obliczeniowej nałożony jest warunek brzegowy Neumanna.

– Uaktualnić punktowo rozwiązanie stężenia C przez C = c + χ, gdzie χ jest generowane losowo z rozkładu jednostajnego pomiędzy a jest używane w prezentowanych symulacjach.

– Rozwiązać równanie (2.3) ze znanym C pod międzyfazowym warunkiem brzegowym z pierwszej części równania (2.5), gdzie lokalna krzywizna jest obliczana z funkcji level-set przez Warunek brzegowy Neumanna jest nałożony na granicy siatki obliczeniowej.

– Obliczamy prędkość V poruszającej się granicy z drugiej części równania (2.4), gdzie jest obliczana z funkcji level-set przez

– Znaleźć odpowiednie Δt zadane przez warunek CFL przez i zaktualizować dziedzinę Ωt do Ωt+Δt.

– Zacznij od nowo zaktualizowanej dziedziny Ωt+Δt i powtórz pięć ostatnich kroków.

Przypisy

© 2014 The Authors. Published by the Royal Society under the terms of the Creative Commons Attribution License http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/, which permits unrestricted use, provided the original author and source are credited.

  • 1
    Martin P. 1997Wound healing-aiming for perfect skin regeneration. Science 276, 75-81. (doi:10.1126/science.276.5309.75). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 2
    Gurtner GC, Werner S, Barrandon Y& Longaker MT. 2008Wound repair and regeneration. Nature 453, 314-321. (doi:10.1038/nature07039). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 3
    Tonnesen MG, Feng X& Clark RAF. 2000Angiogeneza w gojeniu się ran. J. Invest. Dermatol. Symp. Proc. 5, 40-46. (doi:10.1046/j.1087-0024.2000.00014.x). Crossref, PubMed, Google Scholar
  • 4
    Redd MJ, Cooper L, Wood W, Stramer B& Martin P. 2004Wound healing and inflammation: embryos reveal the way to perfect repair. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B 359, 777-784. (doi:10.1098/rstb.2004.1466). Link, ISI, Google Scholar
  • 5
    Bayat A, McGrouther DA& Ferguson MWJ. 2003Skin scarring. Br. Med. J. 326, 88-92. (doi:10.1136/bmj.326.7380.88). Crossref, PubMed, Google Scholar
  • 6
    Eming SA, Krieg T& Davidson JM. 2007Inflammation in wound repair: molecular and cellular mechanisms. J. Invest. Dermatol. 127, 514-525. (doi:10.1038/sj.jid.5700701). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 7
    Tepole AB& Kuhl E. 2013Systems-based approaches toward wound healing. Pediatr. Res. 73, 553-563. (doi:10.1038/pr.2013.3). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 8
    Werner S, Krieg T& Smola H. 2007Keratinocyte-fibroblast interactions in wound healing. J. Invest. Dermatol. 127, 998-1008. (doi:10.1038/sj.jid.5700786). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 9
    O’Leary R, Arrowsmith M& Wood EJ. 2002Characterization of the living skin equivalent as a model of cutaneous re-epithelialization. Cell Biochem. Funct. 20, 129-141. (doi:10.1002/cbf.965). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 10
    Trepat X, Wasserman MR, Angelini TE, Millet E, Weitz DA, Butler JP& Fredberg JJ. 2009Physical forces during collective cell migration. Nat. Phys. 5, 426-430. (doi:10.1038/nphys1269). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 11
    Anon E, Serra-Picamal X, Hersen P, Gauthier NC, Sheetz MP, Trepat X& Ladoux B. 2012Cell crawling mediates collective cell migration to close undamaged epithelial gaps. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 10 891-10 896. (doi:10.1073/pnas.1117814109). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 12
    Cochet-Escartin O, Ranft J, Silberzan P& Marcq P. 2014Border forces and friction control epithelial closure dynamics. Biophys. J. 106, 65-73. (doi:10.1016/j.bpj.2013.11.015). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 13
    Kim JH, et al.2013Propulsion and navigation within the advancing monolayer sheet. Nat. Mater. 12, 856-863. (doi:10.1038/nmat3689). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 14
    Nassar D, Letavernier E, Baud L, Aractingi S& Khosrotehrani K. 2012Calpain activity is essential in skin wound healing and contributes to scar formation. PLoS ONE 7, e37084. (doi:10.1371/journal.pone.0037084). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 15
    Carrier P, Deschambeault A, Talbot M, Giasson CJ, Auger FA, Guèrin SL& Germain L. 2008Characterization of wound reepithelialization using a new human tissue-engineered corneal wound healing model. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 49, 1376-1385. (doi:10.1167/ivos.07-0904). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 16
    Poujade M, Grasland-Mongrain E, Hertzog A, Jouanneau J, Chavrier P, Ladoux B, Buguin A& Silberzan P. 2007Collective migration of an epithelial monolayer in response to a model wound. Proc. Natl Acad. Sci. USA 104, 15 988-15 993. (doi:10.1073/pnas.0705062104). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 17
    Saez A, Anon E, Ghibaudo M, du Roure O, Meglio JMD, Hersen P, Silberzan P, Buguin A& Ladoux B. 2010Traction forces exerted by epithelial cell sheets. J. Phys.: Condens. Matter 22, 194119. (doi:10.1088/0953-8984/22/19/194119). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 18
    Ben Amar M. 2013Chemotaksja migracji i morfogeneza żywych kolonii. Eur. Phys. J. E 36, 64. (doi:10.1140/epje/i2013-13064-5). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 19
    Lowengrub JS, Frieboes HB, Jin F, Chuang YL, Li X, Macklin P, Wise S& Cristini V. 2010Nonlinear modelling of cancer: bridging the gap between cells and tumours. Nonlinearity 23, R1. (doi:10.1088/0951-7715/23/1/R01). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 20
    Callan-Jones A, Joanny JF& Prost J. 2008Viscous-fingering-like instability of cell fragments. Phys. Rev. Lett. 100, 258106. (doi:10.1103/PhysRevLett.100.258106). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 21
    Ben Amar M, Manyuhina OV& Napoli G. 2011Cell motility: a viscous fingering analysis of active gels. Eur. Phys. J. Plus 126, 1-15. (doi:10.1140/epjp/i2011-11019-7). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 22
    King JR& Franks SJ. 2007Stability properties of some tissue-growth models. Mathematical modeling of biological systems, vol. 1 (eds , Deutsch A, Brusch L, Byrne HM, Vries G& Herzel H), p. 175. Basel, Switzerland: Birkhauser. Crossref, Google Scholar
  • 23
    Dervaux J, Magniez J& Libchaber A. In press. On growth and form of bacillus subtilis biofilms. Interface Focus. Google Scholar
  • 24
    Osher S& Sethian JA. 1988Fronty propagujące się z prędkością zależną od krzywizny: algorytmy oparte na formułach Hamiltona-Jacobiego. Comput. Phys. 79, 12-49 (doi:10.1016/0021-9991(88)90002-2). Crossref, Google Scholar
  • 25
    Sethian A. 1999Level set methods and fast marching methods. New York, NY: Cambridge University Press. Google Scholar
  • 26
    Osher S& Fedkiw R. 2002Level set methods and dynamic implicit surfaces. New York, NY: Springer. Google Scholar
  • 27
    Macklin P& Lowengrub JS. 2006An improved geometry-aware curvature discretization for level set methods: application to tumor growth. J. Comput. Phys. 215, 392401. (doi:10.1016/j.jcp.2005.11.016). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 28
    Macklin P& Lowengrub JS. 2008A new ghost cell/level set method for moving boundary problems: application to tumor growth. J. Sci. Comput. 35, 26699. (doi:10.1007/s10915-008-9190-z). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 29
    Macklin P, McDougall S, Anderson AR, Chaplain MA, Cristini V& Lowengrub J. 2009Multiscale modelling and nonlinear simulation of vascular tumour growth. J. Math. Biol. 58, 765-798. (doi:10.1007/s00285-008-0216-9). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 30
    Wu M, Frieboes HB, McDougall SR, Chaplain MA, Cristini V& Lowengrub JS. 2013The effect of interstitial pressure on tumor growth: coupling with the blood and lymphatic vascular systems. J. Theor. Biol. 320, 131-151. (doi:10.1016/j.jtbi.2012.11.031). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 31
    Puliafito A, Hufnagel L, Neveu P, Streichan S, Sigal A, Fygenson DK& Shraiman BI. 2012Collective and single cell behavior in epithelial contact inhibition. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 739-744. (doi:10.1073/pnas.1007809109). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 32
    Crowdy D. 2002On a class of geometry driven free boundary problems. SIAM. J. Appl. Math. 62, 945-964. (doi:10.1137/S0036139999357988). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 33
    Cummings LJ& King JR. 2004Hele-Shaw flow with a point sink: generic solution breakdown. Eur. J. Appl. Math. 15, 1-37. (doi:10.1017/S095679250400539X). Crossref, ISI, Google Scholar
  • 34
    Rogers KW& Schier AF. 2011Morphogen gradients: from generation to interpretation. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27, 377-407. (doi:10.1146/annurev-cellbio-092910-154148). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 35
    Danjo Y& Gipson IK. 1998Actin 'purse string’ filamenty są zakotwiczone przez E-cadherin-mediated adherens junctions na wiodącej krawędzi rany nabłonka, zapewniając skoordynowany ruch komórek. J. Cell Sci. 111, 3323-3332. PubMed, ISI, Google Scholar
  • 36
    Haase I, Evans R, Pofahl R& Watt FM. 2003Regulation of keratinocyte shape, migration and wound epithelialization by IGF-1- and EGF-dependent signalling pathways. J. Cell Sci. 116, 3227-3238. (doi:10.1242/jcs.00610). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 37
    Gabbiani G. 2003The myofibroblast in wound healing and fibrocontractive diseases. J. Pathol. 200, 500-503. (doi:10.1002/path.1427). Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • 38
    Ciarletta P& Ben Amar M. 2012Papillary networks in the dermal-epidermal junction of skin: a biomechanical model. Mech. Res. Commun. 42, 68-76. (doi:10.1016/j.mechrescom.2011.12.001). Crossref, ISI, Google Scholar

.

Similar Posts

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.