Fasta File

Sekvensdata innehåller sekvenser av rester utan strukturella data. Framtagningen och noggrannheten hos sådana filer är föremål för forskning, men formaten tenderar att vara enkla.

*.fasta

Användningsändamål

Sekvensinformation som genereras av sekvensanpassningspaketet FASTA.

Format

FASTA-formatet beskrivs här

Exempel

I det här exemplet är 2ptl_ identifikatorn (med hjälp av PDB:s namn). 1-120 beskriver det intervall av rester som filen innehåller: Exempel B.9. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Vissa program, inklusive stepwise och rna_denovo, tar flera kedjor som indata och tillåter att kedja och rester specificeras i taggar som C:10-121 i FASTA-rubrikerna.

Se även

• Lista över filtyper: Lista över filtyper som används i Rosetta
• Rosetta Basics: Rosetta Basics: Startsidan för Rosetta Basics
• Översikt över alternativ: Översikt över Rosettas kommandoradsalternativ
• Ordlista: Korta definitioner av Rosetta-termer
• RosettaEncyclopedia: Detaljerade beskrivningar av ytterligare begrepp i Rosetta.
• Översikt över Rosetta: Översikt över de viktigaste begreppen i Rosetta
• Applikationsdokumentation: Länkar till dokumentation för en rad olika Rosetta-tillämpningar

.