Du kan använda SMART i två olika lägen: normalt eller genomiskt.Den viktigaste skillnaden är den underliggande proteindatabas som används. I normal SMART innehåller databasen Swiss-Prot, SP-TrEMBL och stabila Ensembl-proteom. I Genomic SMART används endast proteomerna i fullständigt sekvenserade genomer; Ensembl för metazoer och Swiss-Prot för resten. Den fullständiga listan över genomer i Genomic SMART finns här.
Proteindatabasen i Normal SMART har betydande redundans, även om identiska proteiner tas bort. Om du använder SMART för att utforska domänarkitekturer, eller om du vill hitta exakta domänantal i olika genomer, bör du överväga att byta till Genomic-läget. Siffrorna på sidorna med domänannotationer kommer att vara mer exakta, och det kommer inte att finnas många proteinfragment som motsvarar samma gen i resultaten av arkitekturförfrågan. Kom dock ihåg att du utforskar en begränsad uppsättning genomer.
Differenta färgscheman används för att enkelt identifiera vilket läge du befinner dig i.
Normalläge | Genomiskt läge |
Klicka på bilderna ovan för att välja ditt standardläge.
Information om det valda läget sparas i en cookie i webbläsaren. Om du av någon anledning inte vill/kan använda cookies kan du få tillgång till SMART via den här sidan.