Välj standardläge för SMART

author
1 minute, 8 seconds Read

Du kan använda SMART i två olika lägen: normalt eller genomiskt.Den viktigaste skillnaden är den underliggande proteindatabas som används. I normal SMART innehåller databasen Swiss-Prot, SP-TrEMBL och stabila Ensembl-proteom. I Genomic SMART används endast proteomerna i fullständigt sekvenserade genomer; Ensembl för metazoer och Swiss-Prot för resten. Den fullständiga listan över genomer i Genomic SMART finns här.

Proteindatabasen i Normal SMART har betydande redundans, även om identiska proteiner tas bort. Om du använder SMART för att utforska domänarkitekturer, eller om du vill hitta exakta domänantal i olika genomer, bör du överväga att byta till Genomic-läget. Siffrorna på sidorna med domänannotationer kommer att vara mer exakta, och det kommer inte att finnas många proteinfragment som motsvarar samma gen i resultaten av arkitekturförfrågan. Kom dock ihåg att du utforskar en begränsad uppsättning genomer.

Differenta färgscheman används för att enkelt identifiera vilket läge du befinner dig i.

Normalläge Genomiskt läge

Klicka på bilderna ovan för att välja ditt standardläge.

Information om det valda läget sparas i en cookie i webbläsaren. Om du av någon anledning inte vill/kan använda cookies kan du få tillgång till SMART via den här sidan.

Similar Posts

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.