Los datos de secuencia contienen secuencias de residuos sin datos estructurales. La derivación y la precisión de tales archivos es objeto de investigación pero los formatos tienden a ser simples.
*.fastaPropósito de la aplicación
Información de secuencias generada por el paquete de alineación de secuencias FASTA.
Formato
El formato de FASTA se describe aquí
Ejemplo
En este ejemplo 2ptl_ es el identificador (usando el nombre del PDB). 1-120 describe el rango de residuos que contiene el archivo. : Ejemplo B.9. FASTA
>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAlgunas aplicaciones, incluyendo stepwise y rna_denovo, toman varias cadenas como entrada, y permiten especificar la cadena y los residuos en etiquetas como C:10-121 en las cabeceras de FASTA.
Ver también
- Lista de tipos de archivos: Lista de tipos de archivo utilizados en Rosetta
- Fundamentos de Rosetta: La página de inicio de los fundamentos de Rosetta
- Visión general de las opciones: Visión general de las opciones de la línea de comandos de Rosetta
- Glosario: Breves definiciones de términos de Rosetta
- RosettaEncyclopedia: Descripciones detalladas de conceptos adicionales en Rosetta.
- Visión general de Rosetta: Visión general de los principales conceptos de Rosetta
- Documentación de aplicaciones: Enlaces a la documentación de una variedad de aplicaciones de Rosetta