Fasta File

A szekvenciaadatok szerkezeti adatok nélküli maradékok szekvenciáit tartalmazzák. Az ilyen fájlok származtatása és pontossága kutatások tárgya, de a formátumok általában egyszerűek.

*.fasta

Alkalmazás célja

A FASTA szekvenciaillesztési csomag által generált szekvenciainformáció.

Formátum

A FASTA formátumát itt ismertetjük

Példa

Ebben a példában a 2ptl_ az azonosító (a PDB nevével). Az 1-120 a fájlban található maradékok tartományát írja le : B.9. példa. FASTA

>2ptl_ 1-120VTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFAAAAAVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEYTVDVADKGYTLNIKFA

Egyes alkalmazások, köztük a stepwise és az rna_denovo, több láncot fogadnak el bemenetként, és lehetővé teszik a lánc és a maradékok megadását a FASTA fejlécében található C:10-121 típusú címkékben.

Lásd még

• Fájltípusok listája: A Rosettában használt fájltípusok listája
• Rosetta alapjai: A Rosetta alapjai kezdőlap
• Az opciók áttekintése: A Rosetta parancssori opciók áttekintése
• Szójegyzék: A Rosetta kifejezések rövid definíciói
• RosettaEncyclopedia: A Rosetta további fogalmainak részletes leírása.
• Rosetta áttekintés: A Rosetta főbb fogalmainak áttekintése
• Alkalmazási dokumentáció: Linkek különböző Rosetta-alkalmazások dokumentációjához