物理的なコントラストは限られている土地である。 北部にはアデン湾沿岸に平行する半砂漠状の海洋性平原があり、西はおよそ12キロメートル、東はわずか2キロメートルと幅に差がある。 グバン（低木林）と呼ばれるこの平原には、広く浅い水路が縦横に走り、雨季以外は乾いた砂地となる。 雨が降ると、低い潅木と草の塊からなる植生はすぐに更新され、一時的にグバンは遊牧民の家畜のための草地となる。 この海岸線は、エチオピアの乾燥草原および低木林エコリージョンに属している。
湾岸から内陸に入ると、平原は北向きの断崖絶壁の高地へと上昇している。 これらは、北西のエチオピアとの国境から東へ、アフリカの角の先端まで延びる険しいカルカール山脈を形成し、カセイアで断崖絶壁になる。 山頂の標高は、港町ベルベラの南側で平均1,800m、そこから東へ1,800〜2,100mでカセアまで続いている。 この国の最高峰である標高2,460mのシムベル・ベリスは、エリガヴォの町の近くにある。
南方では、山々はしばしば崖を作りながら下り、多年性の河川のない高台になる。
オゴの特に乾燥した東部では、いくつかの孤立した山脈に挟まれた台地が徐々にソマリア海に向かって傾斜し、ソマリア中央部ではムドゥグ平野を構成している。 この東部の大きな特徴は、長く広いヌガール渓谷と、断続的に流れる季節の水路のネットワークである。 ヌガール川はエイルでソマリ海に注ぐ。
オゴ高原の西部は、浅い谷と乾いた水路が多数横切っている。 年間降水量は東部に比べて多く、平坦な耕地が広がっており、乾地耕作者の住処となっている。 また、西部には井戸があり、乾季になると遊牧民が戻ってくる。 西部の高原は緩やかな南向きの傾斜を持ち、気づかないうちにハウドと呼ばれる地域に合流している。ハウドは広く起伏のある地形で、1年の半分以上は降雨がないにもかかわらず、ソマリアの遊牧民にとって最高の放牧地である。
ハウド地帯はエチオピアまで60km以上続いており、広大なソマリア高原は北部のソマリア山脈とエチオピア南東の高地の間にあり、エチオピアを通って南と東にソマリア中央部と南西部に伸びている。 エチオピア国内に横たわるハウドの部分は、植民地時代に結ばれた協定の対象であった。 1948年、第二次世界大戦の同盟国からの圧力とソマリア人の落胆を受け、英国はハウド（1884年と1886年の英国によるソマリア人との条約で「保護」されていたと思われるソマリアの重要な放牧地）とオガデンをエチオピアに「返還」した。これは、英国がソマリアの一族の略奪に対する援助を条件にエチオピア皇帝メネリックにソマリ領域を譲り入れた1897年の条約に基づくものである。 イギリスはソマリアの遊牧民の自治権を保持することを条件としていたが、エチオピアは即座に彼らの主権を主張するようになった。 そのため、1956年にイギリスは譲り受けたソマリの土地を買い戻そうとしたが、失敗に終わった。
ソマリア南西部は、国内で唯一永久に流れるジュバ川とシャベレ川によって支配されている。 エチオピア高地を水源とするこれらの川は、海に向かって下降しながらソマリア高原に広い谷を切り開き、この地域で高原の標高が急速に低下するため、概して南向きに流れている。 河川の下流域を含み、ムドゥグ平野からケニア国境に至る隣接した海岸地帯は、平均して海抜180mである。
ジュバ川はキズマヨでソマリア海に入る。 シャベレ川もかつてはメルカ付近で海に達していたらしいが、先史時代にその流れが変わったと考えられている。 現在、シャベレ川はバルカド（モガディシュの北約30km）付近で南西に曲がり、85km以上にわたって海岸と平行して流れている。 モガディシュの南西の地点までが多年生河川で、それ以降は湿地帯と乾燥域からなり、最後はジュバ川からほど近いジリブの東で砂に埋もれて見えなくなる。 洪水期には、シャベレ川はジリブの近くまで川底を埋め尽くし、さらに南のジュバ川まで流れ込むことがある。
降雨量の少ない北部、北東部、北中部のソマリアでは、植生は様々なアカシアなどの低木と、広く点在する草地からなる。 この植生は、北東部とアデン湾沿いの乾燥度の高い地域では低い潅木と草の塊の組み合わせに変わる。
北部の海洋性山脈で標高と降水量が増加すると、植生はより密になる。 アロエがよく見られ、オゴの高台地域は森林地帯となっている。 1,500m以上のいくつかの場所では、ビャクシンの森の名残（国によって保護されている）や、Euphorbia candelabrum（シャンデリア型のトゲのある植物）の地域が発生します。
北部の都市ハルゲイサを囲む広い高原は、比較的降雨量が多く、自然に森林（その多くは過放牧によって劣化している）に覆われ、ところどころに広大な草原がある。 この地域の一部は1930年代から耕作が行われており、ソルガムやトウモロコシを生産している。
Hargeysaの南のHaudは、家畜が飼料として特に好む種を含む草の下に、主にアカシアの散在する半乾燥森林が大部分を占めている。 この植生は、上空から見ると虎の皮を連想させるような周期的なパターンを形成しており、そのため「タイガーブッシュ」と呼ばれている。 Haudがソマリア中央部のMudug平野に合流すると、乾燥度が増し、植生は亜砂漠の様相を呈してくる。
シャベレ川とジュバ川に囲まれた地域は、比較的水が豊富で、国内で最も耕作しやすい地域である。 両河川に挟まれた低地は豊かな牧草地を支えている。 乾燥から亜乾燥のサバンナ、開けた森林、下草を多く含む雑木林がある。
ソマリア海沿いのホビョから南西に向かいモガディシュの近くまで、乾燥した海岸砂丘が広がっており、ホビョ草原と低木林エコリージョンである。 この地域は、散在する低木と草の塊で覆われており、降雨は予測できないが十分である。 この海岸の多くは人口が少ないが、特にモガディシュの南側では過放牧により、保護植生の被覆が破壊され、かつては定常状態にあった砂丘が徐々に内陸へと移動している。 この海岸にもともとあった植物群には多くの固有種があり、1970年代初頭から植林によって砂丘を安定させる努力が行われてきた。 哺乳類では、世界最小のアンテロープであるシルバーディクディク（Madoqua piacentinii）、ソマリアゴールデンモグラ（Calcochloris tytonis）などが固有種である。 その他、爬虫類では、スキンクのHaackgreerius miopusとトカゲのLatastia cherchii、鳥類では、アッシュヒバリ（Mirafra ashi）とオビアヒバリ（Spizocorys obbiensis）が固有種として知られています。 ソマリアでの長期にわたる政治的抗争のため、海岸はあまり研究されておらず、生息地の状態も不明である。
その他の植生としては、シャベレ川が一年の大半を注ぎ込む沼地やジュバ川下流の他の大きな沼地で見られる植物や草がある。 東アフリカのマングローブの湿地は、海岸沿い、特にキスマヨからケニア国境付近までの地点で見られる。 無秩序な開発で森林に被害が出ているようだ。 その他、モガディシュ近郊や北東部、北部の海岸沿いにもマングローブがある
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