El objetivo de este estudio fue evaluar la prevalencia del aneurisma septal interatrial (ASA) en recién nacidos, definir el curso natural del ASA e investigar su papel en el cierre de la apertura septal interatrial asociada (ASI). Se examinó a un total de 1072 neonatos consecutivos con ecocardiografía en el periodo postnatal temprano. Se midieron la longitud del tabique interauricular, el diámetro de la ASI, la excursión y la base del aneurisma, y la anchura de la aurícula relacionada, y se calcularon el ratio de excursión y el ratio basal para cada neonato. Los aneurismas con un ratio de excursión > o = 25% se diagnosticaron como ASA. Hubo 81 neonatos (7,6%) con ASA. La prevalencia de ASA fue del 11,1% en los prematuros (14 de 126) y del 7,1% en los recién nacidos a término (67 de 946). Todos los ASA desaparecieron al final del primer año de vida, y no hubo complicaciones relacionadas con la lesión durante el periodo de seguimiento. Aunque la prevalencia global de la IASO fue del 78,6% (843 de 1072), fue del 72,8% (59 de 81) entre los casos con ASA. Aunque el tiempo de desaparición de la derivación septal interatrial no fue significativamente diferente entre los casos con y sin ASA, el cierre espontáneo fue menos frecuente en los casos con ASA que en los que no tenían ASA 77,7 y 96,1%), respectivamente (p < 0,001). La prevalencia del ASA es elevada entre los recién nacidos, con una alta tasa de resolución. Por lo tanto, se puede considerar que es una observación benigna y transitoria. La menor frecuencia de cierre espontáneo de la IASO en los casos con ASA indica que ésta puede tener un efecto deletéreo sobre el cierre espontáneo.