Puede utilizar SMART en dos modos diferentes: normal o genómico.La principal diferencia está en la base de datos de proteínas subyacente utilizada. En SMART normal, la base de datos contiene Swiss-Prot, SP-TrEMBL y proteomas estables de Ensembl. En Genomic SMART, sólo se utilizan los proteomas de los genomas completamente secuenciados; Ensembl para los metazoos y Swiss-Prot para el resto. La lista completa de genomas en Genomic SMART está disponible aquí.
La base de datos de proteínas en Normal SMART tiene una redundancia significativa, aunque se eliminan las proteínas idénticas. Si utiliza SMART para explorar las arquitecturas de los dominios, o quiere encontrar los recuentos exactos de los dominios en varios genomas, considere cambiar al modo Genómico. Los números en las páginas de anotación de dominios serán más precisos, y no habrá muchos fragmentos de proteínas correspondientes al mismo gen en los resultados de la consulta de arquitectura. Sin embargo, recuerde que está explorando un conjunto limitado de genomas.
Se utilizan diferentes esquemas de color para identificar fácilmente el modo en el que se encuentra.
| Modo normal | Modo genómico |
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Haga clic en las imágenes de arriba para seleccionar su modo predeterminado.
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