En saprofyt eller saprotrof är en organism som hämtar sin energi från dött och ruttnande organiskt material. Detta kan vara ruttnande delar av växter eller djur. Detta innebär att saprofyter är heterotrofa organismer. De är konsumenter i näringskedjan.
Detta är den typiska livsstilen hos svampar. Vissa svampar är parasiter på levande organismer, men de flesta är saprofyter. Många bakterier och protozoer är också saprofyter. Det mesta döda organiska materialet bryts så småningom ner och används av bakterier och svampar. Slemsvampar är också saprofyter och äter även bakterier. Exempel på saprofyter är ostmögel och jäst. Termen ”saprofyt” avser specifikt svamp- och bakteriesaprotrofer; animaliska saprotrofer kallas saprozoiter.
Andra termer, t.ex. ”saprotrof” eller ”saprobe” kan användas i stället för saprofyt. Strängt taget betyder -phyte ”växt”. Problemet är att inga embryofyter (landväxter) är riktiga saprotrofer, och bakterier och svampar räknas inte längre som växter. Trots detta är saprophyte en så välkänd term att de flesta författare fortsätter att använda den.